Protein–RNA interactions for Protein: Q9H320

VCX, Variable charge X-linked protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VCXQ9H320 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
VCXQ9H320 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
VCXQ9H320 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VCXQ9H320 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VCXQ9H320 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VCXQ9H320 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VCXQ9H320 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
VCXQ9H320 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
VCXQ9H320 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VCXQ9H320 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
VCXQ9H320 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VCXQ9H320 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
VCXQ9H320 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
VCXQ9H320 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
VCXQ9H320 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
VCXQ9H320 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
VCXQ9H320 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
VCXQ9H320 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
VCXQ9H320 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
VCXQ9H320 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
VCXQ9H320 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
VCXQ9H320 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
VCXQ9H320 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
VCXQ9H320 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VCXQ9H320 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VCXQ9H320 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VCXQ9H320 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VCXQ9H320 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VCXQ9H320 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VCXQ9H320 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VCXQ9H320 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
VCXQ9H320 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VCXQ9H320 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
VCXQ9H320 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VCXQ9H320 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
VCXQ9H320 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VCXQ9H320 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VCXQ9H320 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VCXQ9H320 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
VCXQ9H320 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
VCXQ9H320 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
VCXQ9H320 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VCXQ9H320 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VCXQ9H320 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VCXQ9H320 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VCXQ9H320 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
VCXQ9H320 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VCXQ9H320 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VCXQ9H320 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VCXQ9H320 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
VCXQ9H320 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
VCXQ9H320 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VCXQ9H320 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
VCXQ9H320 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
VCXQ9H320 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
VCXQ9H320 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VCXQ9H320 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
VCXQ9H320 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VCXQ9H320 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VCXQ9H320 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
VCXQ9H320 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
VCXQ9H320 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
VCXQ9H320 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
VCXQ9H320 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
VCXQ9H320 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
VCXQ9H320 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VCXQ9H320 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VCXQ9H320 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VCXQ9H320 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
VCXQ9H320 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VCXQ9H320 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
VCXQ9H320 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VCXQ9H320 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
VCXQ9H320 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VCXQ9H320 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
VCXQ9H320 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
VCXQ9H320 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VCXQ9H320 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VCXQ9H320 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
VCXQ9H320 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VCXQ9H320 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VCXQ9H320 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
VCXQ9H320 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VCXQ9H320 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
VCXQ9H320 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VCXQ9H320 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VCXQ9H320 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VCXQ9H320 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
VCXQ9H320 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
VCXQ9H320 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VCXQ9H320 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VCXQ9H320 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
VCXQ9H320 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
VCXQ9H320 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VCXQ9H320 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
VCXQ9H320 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
VCXQ9H320 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
VCXQ9H320 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VCXQ9H320 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VCXQ9H320 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms