Protein–RNA interactions for Protein: Q9H089

LSG1, Large subunit GTPase 1 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 658 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSG1Q9H089 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
LSG1Q9H089 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
LSG1Q9H089 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC28.32■■■□□ 2.12
LSG1Q9H089 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
LSG1Q9H089 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
LSG1Q9H089 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
LSG1Q9H089 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
LSG1Q9H089 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
LSG1Q9H089 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
LSG1Q9H089 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
LSG1Q9H089 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
LSG1Q9H089 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
LSG1Q9H089 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
LSG1Q9H089 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
LSG1Q9H089 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
LSG1Q9H089 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
LSG1Q9H089 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
LSG1Q9H089 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
LSG1Q9H089 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
LSG1Q9H089 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
LSG1Q9H089 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
LSG1Q9H089 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
LSG1Q9H089 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
LSG1Q9H089 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
LSG1Q9H089 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
LSG1Q9H089 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
LSG1Q9H089 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
LSG1Q9H089 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
LSG1Q9H089 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
LSG1Q9H089 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
LSG1Q9H089 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
LSG1Q9H089 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
LSG1Q9H089 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
LSG1Q9H089 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
LSG1Q9H089 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
LSG1Q9H089 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
LSG1Q9H089 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
LSG1Q9H089 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
LSG1Q9H089 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
LSG1Q9H089 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
LSG1Q9H089 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
LSG1Q9H089 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
LSG1Q9H089 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
LSG1Q9H089 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
LSG1Q9H089 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
LSG1Q9H089 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
LSG1Q9H089 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
LSG1Q9H089 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
LSG1Q9H089 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
LSG1Q9H089 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
LSG1Q9H089 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
LSG1Q9H089 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
LSG1Q9H089 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
LSG1Q9H089 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
LSG1Q9H089 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
LSG1Q9H089 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
LSG1Q9H089 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
LSG1Q9H089 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
LSG1Q9H089 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
LSG1Q9H089 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
LSG1Q9H089 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
LSG1Q9H089 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
LSG1Q9H089 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
LSG1Q9H089 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
LSG1Q9H089 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
LSG1Q9H089 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
LSG1Q9H089 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
LSG1Q9H089 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
LSG1Q9H089 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
LSG1Q9H089 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
LSG1Q9H089 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
LSG1Q9H089 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
LSG1Q9H089 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
LSG1Q9H089 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
LSG1Q9H089 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
LSG1Q9H089 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
LSG1Q9H089 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
LSG1Q9H089 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
LSG1Q9H089 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
LSG1Q9H089 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
LSG1Q9H089 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
LSG1Q9H089 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
LSG1Q9H089 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
LSG1Q9H089 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
LSG1Q9H089 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
LSG1Q9H089 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
LSG1Q9H089 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
LSG1Q9H089 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
LSG1Q9H089 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
LSG1Q9H089 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
LSG1Q9H089 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
LSG1Q9H089 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
LSG1Q9H089 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
LSG1Q9H089 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
LSG1Q9H089 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
LSG1Q9H089 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
LSG1Q9H089 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
LSG1Q9H089 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
LSG1Q9H089 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
LSG1Q9H089 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.3 ms