Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0H5

ARHGAP39, Rho GTPase-activating protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 1,083 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGAP39Q9C0H5 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
ARHGAP39Q9C0H5 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ARHGAP39Q9C0H5 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
ARHGAP39Q9C0H5 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ARHGAP39Q9C0H5 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ARHGAP39Q9C0H5 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ARHGAP39Q9C0H5 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ARHGAP39Q9C0H5 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ARHGAP39Q9C0H5 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ARHGAP39Q9C0H5 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ARHGAP39Q9C0H5 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ARHGAP39Q9C0H5 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ARHGAP39Q9C0H5 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ARHGAP39Q9C0H5 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ARHGAP39Q9C0H5 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ARHGAP39Q9C0H5 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ARHGAP39Q9C0H5 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ARHGAP39Q9C0H5 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ARHGAP39Q9C0H5 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ARHGAP39Q9C0H5 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ARHGAP39Q9C0H5 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ARHGAP39Q9C0H5 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ARHGAP39Q9C0H5 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ARHGAP39Q9C0H5 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
ARHGAP39Q9C0H5 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ARHGAP39Q9C0H5 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ARHGAP39Q9C0H5 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ARHGAP39Q9C0H5 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ARHGAP39Q9C0H5 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
ARHGAP39Q9C0H5 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ARHGAP39Q9C0H5 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ARHGAP39Q9C0H5 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ARHGAP39Q9C0H5 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ARHGAP39Q9C0H5 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ARHGAP39Q9C0H5 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
ARHGAP39Q9C0H5 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ARHGAP39Q9C0H5 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ARHGAP39Q9C0H5 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ARHGAP39Q9C0H5 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
ARHGAP39Q9C0H5 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.14■■□□□ 1.93
ARHGAP39Q9C0H5 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
ARHGAP39Q9C0H5 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ARHGAP39Q9C0H5 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ARHGAP39Q9C0H5 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ARHGAP39Q9C0H5 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ARHGAP39Q9C0H5 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ARHGAP39Q9C0H5 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ARHGAP39Q9C0H5 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ARHGAP39Q9C0H5 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ARHGAP39Q9C0H5 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ARHGAP39Q9C0H5 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ARHGAP39Q9C0H5 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ARHGAP39Q9C0H5 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ARHGAP39Q9C0H5 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ARHGAP39Q9C0H5 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
ARHGAP39Q9C0H5 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ARHGAP39Q9C0H5 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
ARHGAP39Q9C0H5 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ARHGAP39Q9C0H5 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ARHGAP39Q9C0H5 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ARHGAP39Q9C0H5 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
ARHGAP39Q9C0H5 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ARHGAP39Q9C0H5 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ARHGAP39Q9C0H5 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ARHGAP39Q9C0H5 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ARHGAP39Q9C0H5 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ARHGAP39Q9C0H5 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ARHGAP39Q9C0H5 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ARHGAP39Q9C0H5 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
ARHGAP39Q9C0H5 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ARHGAP39Q9C0H5 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ARHGAP39Q9C0H5 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ARHGAP39Q9C0H5 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
ARHGAP39Q9C0H5 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
ARHGAP39Q9C0H5 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ARHGAP39Q9C0H5 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ARHGAP39Q9C0H5 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ARHGAP39Q9C0H5 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ARHGAP39Q9C0H5 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ARHGAP39Q9C0H5 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ARHGAP39Q9C0H5 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ARHGAP39Q9C0H5 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ARHGAP39Q9C0H5 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ARHGAP39Q9C0H5 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ARHGAP39Q9C0H5 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ARHGAP39Q9C0H5 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ARHGAP39Q9C0H5 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ARHGAP39Q9C0H5 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ARHGAP39Q9C0H5 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ARHGAP39Q9C0H5 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ARHGAP39Q9C0H5 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ARHGAP39Q9C0H5 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
ARHGAP39Q9C0H5 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ARHGAP39Q9C0H5 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ARHGAP39Q9C0H5 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ARHGAP39Q9C0H5 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ARHGAP39Q9C0H5 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ARHGAP39Q9C0H5 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ARHGAP39Q9C0H5 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ARHGAP39Q9C0H5 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms