Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C9

UBE2O, (E3-independent) E2 ubiquitin-conjugating enzyme, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2OQ9C0C9 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
UBE2OQ9C0C9 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
UBE2OQ9C0C9 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
UBE2OQ9C0C9 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
UBE2OQ9C0C9 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
UBE2OQ9C0C9 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
UBE2OQ9C0C9 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
UBE2OQ9C0C9 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
UBE2OQ9C0C9 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC26.2■■□□□ 1.78
UBE2OQ9C0C9 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.2■■□□□ 1.78
UBE2OQ9C0C9 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
UBE2OQ9C0C9 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
UBE2OQ9C0C9 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
UBE2OQ9C0C9 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
UBE2OQ9C0C9 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
UBE2OQ9C0C9 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
UBE2OQ9C0C9 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
UBE2OQ9C0C9 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
UBE2OQ9C0C9 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
UBE2OQ9C0C9 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
UBE2OQ9C0C9 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
UBE2OQ9C0C9 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
UBE2OQ9C0C9 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
UBE2OQ9C0C9 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
UBE2OQ9C0C9 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
UBE2OQ9C0C9 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
UBE2OQ9C0C9 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
UBE2OQ9C0C9 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
UBE2OQ9C0C9 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
UBE2OQ9C0C9 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
UBE2OQ9C0C9 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
UBE2OQ9C0C9 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
UBE2OQ9C0C9 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
UBE2OQ9C0C9 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
UBE2OQ9C0C9 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
UBE2OQ9C0C9 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
UBE2OQ9C0C9 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
UBE2OQ9C0C9 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
UBE2OQ9C0C9 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
UBE2OQ9C0C9 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
UBE2OQ9C0C9 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
UBE2OQ9C0C9 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
UBE2OQ9C0C9 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
UBE2OQ9C0C9 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
UBE2OQ9C0C9 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
UBE2OQ9C0C9 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
UBE2OQ9C0C9 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
UBE2OQ9C0C9 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
UBE2OQ9C0C9 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
UBE2OQ9C0C9 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
UBE2OQ9C0C9 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
UBE2OQ9C0C9 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
UBE2OQ9C0C9 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
UBE2OQ9C0C9 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
UBE2OQ9C0C9 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
UBE2OQ9C0C9 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
UBE2OQ9C0C9 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
UBE2OQ9C0C9 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
UBE2OQ9C0C9 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
UBE2OQ9C0C9 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
UBE2OQ9C0C9 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
UBE2OQ9C0C9 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
UBE2OQ9C0C9 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
UBE2OQ9C0C9 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
UBE2OQ9C0C9 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
UBE2OQ9C0C9 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
UBE2OQ9C0C9 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
UBE2OQ9C0C9 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
UBE2OQ9C0C9 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
UBE2OQ9C0C9 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
UBE2OQ9C0C9 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
UBE2OQ9C0C9 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
UBE2OQ9C0C9 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
UBE2OQ9C0C9 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
UBE2OQ9C0C9 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
UBE2OQ9C0C9 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
UBE2OQ9C0C9 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
UBE2OQ9C0C9 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
UBE2OQ9C0C9 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
UBE2OQ9C0C9 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
UBE2OQ9C0C9 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
UBE2OQ9C0C9 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
UBE2OQ9C0C9 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
UBE2OQ9C0C9 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
UBE2OQ9C0C9 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
UBE2OQ9C0C9 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
UBE2OQ9C0C9 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
UBE2OQ9C0C9 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
UBE2OQ9C0C9 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
UBE2OQ9C0C9 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
UBE2OQ9C0C9 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
UBE2OQ9C0C9 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
UBE2OQ9C0C9 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
UBE2OQ9C0C9 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
UBE2OQ9C0C9 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
UBE2OQ9C0C9 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
UBE2OQ9C0C9 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
UBE2OQ9C0C9 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
UBE2OQ9C0C9 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
UBE2OQ9C0C9 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.5 ms