Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0B2

CFAP74, Cilia- and flagella-associated protein 74, humanhuman

Predictions only

Length 1,584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP74Q9C0B2 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.32■■■■□ 3.41
CFAP74Q9C0B2 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC36.32■■■■□ 3.41
CFAP74Q9C0B2 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.32■■■■□ 3.4
CFAP74Q9C0B2 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.32■■■■□ 3.4
CFAP74Q9C0B2 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
CFAP74Q9C0B2 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC36.32■■■■□ 3.4
CFAP74Q9C0B2 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC36.32■■■■□ 3.4
CFAP74Q9C0B2 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
CFAP74Q9C0B2 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
CFAP74Q9C0B2 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
CFAP74Q9C0B2 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC36.3■■■■□ 3.4
CFAP74Q9C0B2 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC36.3■■■■□ 3.4
CFAP74Q9C0B2 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC36.3■■■■□ 3.4
CFAP74Q9C0B2 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
CFAP74Q9C0B2 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC36.3■■■■□ 3.4
CFAP74Q9C0B2 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC36.29■■■■□ 3.4
CFAP74Q9C0B2 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
CFAP74Q9C0B2 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.29■■■■□ 3.4
CFAP74Q9C0B2 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
CFAP74Q9C0B2 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.29■■■■□ 3.4
CFAP74Q9C0B2 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
CFAP74Q9C0B2 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC36.28■■■■□ 3.4
CFAP74Q9C0B2 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC36.28■■■■□ 3.4
CFAP74Q9C0B2 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.28■■■■□ 3.4
CFAP74Q9C0B2 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
CFAP74Q9C0B2 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC36.28■■■■□ 3.4
CFAP74Q9C0B2 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC36.27■■■■□ 3.4
CFAP74Q9C0B2 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC36.27■■■■□ 3.4
CFAP74Q9C0B2 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.27■■■■□ 3.4
CFAP74Q9C0B2 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
CFAP74Q9C0B2 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.27■■■■□ 3.4
CFAP74Q9C0B2 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
CFAP74Q9C0B2 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
CFAP74Q9C0B2 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
CFAP74Q9C0B2 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
CFAP74Q9C0B2 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.26■■■■□ 3.4
CFAP74Q9C0B2 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.39
CFAP74Q9C0B2 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
CFAP74Q9C0B2 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC36.25■■■■□ 3.39
CFAP74Q9C0B2 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
CFAP74Q9C0B2 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC36.24■■■■□ 3.39
CFAP74Q9C0B2 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
CFAP74Q9C0B2 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
CFAP74Q9C0B2 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC36.23■■■■□ 3.39
CFAP74Q9C0B2 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
CFAP74Q9C0B2 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
CFAP74Q9C0B2 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
CFAP74Q9C0B2 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
CFAP74Q9C0B2 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC36.22■■■■□ 3.39
CFAP74Q9C0B2 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
CFAP74Q9C0B2 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
CFAP74Q9C0B2 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC36.22■■■■□ 3.39
CFAP74Q9C0B2 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC36.21■■■■□ 3.39
CFAP74Q9C0B2 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
CFAP74Q9C0B2 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
CFAP74Q9C0B2 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC36.21■■■■□ 3.39
CFAP74Q9C0B2 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC36.2■■■■□ 3.39
CFAP74Q9C0B2 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.38
CFAP74Q9C0B2 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC36.19■■■■□ 3.38
CFAP74Q9C0B2 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC36.19■■■■□ 3.38
CFAP74Q9C0B2 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC36.19■■■■□ 3.38
CFAP74Q9C0B2 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC36.19■■■■□ 3.38
CFAP74Q9C0B2 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
CFAP74Q9C0B2 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC36.18■■■■□ 3.38
CFAP74Q9C0B2 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
CFAP74Q9C0B2 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
CFAP74Q9C0B2 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
CFAP74Q9C0B2 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
CFAP74Q9C0B2 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
CFAP74Q9C0B2 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
CFAP74Q9C0B2 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
CFAP74Q9C0B2 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC36.17■■■■□ 3.38
CFAP74Q9C0B2 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC36.16■■■■□ 3.38
CFAP74Q9C0B2 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC36.16■■■■□ 3.38
CFAP74Q9C0B2 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC36.16■■■■□ 3.38
CFAP74Q9C0B2 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
CFAP74Q9C0B2 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
CFAP74Q9C0B2 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC36.16■■■■□ 3.38
CFAP74Q9C0B2 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
CFAP74Q9C0B2 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
CFAP74Q9C0B2 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
CFAP74Q9C0B2 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
CFAP74Q9C0B2 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC36.15■■■■□ 3.38
CFAP74Q9C0B2 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
CFAP74Q9C0B2 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
CFAP74Q9C0B2 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC36.14■■■■□ 3.38
CFAP74Q9C0B2 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
CFAP74Q9C0B2 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC36.14■■■■□ 3.38
CFAP74Q9C0B2 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC36.14■■■■□ 3.38
CFAP74Q9C0B2 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC36.14■■■■□ 3.38
CFAP74Q9C0B2 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC36.14■■■■□ 3.38
CFAP74Q9C0B2 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC36.13■■■■□ 3.37
CFAP74Q9C0B2 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC36.13■■■■□ 3.37
CFAP74Q9C0B2 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
CFAP74Q9C0B2 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.13■■■■□ 3.37
CFAP74Q9C0B2 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
CFAP74Q9C0B2 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC36.12■■■■□ 3.37
CFAP74Q9C0B2 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
CFAP74Q9C0B2 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
CFAP74Q9C0B2 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms