Protein–RNA interactions for Protein: Q9C019

TRIM15, Tripartite motif-containing protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM15Q9C019 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRIM15Q9C019 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TRIM15Q9C019 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TRIM15Q9C019 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM15Q9C019 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM15Q9C019 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM15Q9C019 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM15Q9C019 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM15Q9C019 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM15Q9C019 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM15Q9C019 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM15Q9C019 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM15Q9C019 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM15Q9C019 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM15Q9C019 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM15Q9C019 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM15Q9C019 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM15Q9C019 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM15Q9C019 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM15Q9C019 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM15Q9C019 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM15Q9C019 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM15Q9C019 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM15Q9C019 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM15Q9C019 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM15Q9C019 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM15Q9C019 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM15Q9C019 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM15Q9C019 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM15Q9C019 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM15Q9C019 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM15Q9C019 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM15Q9C019 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM15Q9C019 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM15Q9C019 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM15Q9C019 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM15Q9C019 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM15Q9C019 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM15Q9C019 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM15Q9C019 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM15Q9C019 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM15Q9C019 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM15Q9C019 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM15Q9C019 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM15Q9C019 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM15Q9C019 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM15Q9C019 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM15Q9C019 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM15Q9C019 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM15Q9C019 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM15Q9C019 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIM15Q9C019 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIM15Q9C019 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIM15Q9C019 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIM15Q9C019 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIM15Q9C019 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIM15Q9C019 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIM15Q9C019 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM15Q9C019 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM15Q9C019 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM15Q9C019 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM15Q9C019 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM15Q9C019 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM15Q9C019 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM15Q9C019 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM15Q9C019 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM15Q9C019 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM15Q9C019 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM15Q9C019 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM15Q9C019 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM15Q9C019 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM15Q9C019 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM15Q9C019 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM15Q9C019 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM15Q9C019 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM15Q9C019 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIM15Q9C019 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIM15Q9C019 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIM15Q9C019 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIM15Q9C019 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIM15Q9C019 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIM15Q9C019 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIM15Q9C019 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIM15Q9C019 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIM15Q9C019 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIM15Q9C019 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIM15Q9C019 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIM15Q9C019 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIM15Q9C019 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM15Q9C019 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM15Q9C019 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM15Q9C019 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM15Q9C019 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM15Q9C019 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM15Q9C019 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM15Q9C019 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM15Q9C019 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM15Q9C019 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM15Q9C019 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM15Q9C019 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms