Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZQ6

EDEM3, ER degradation-enhancing alpha-mannosidase-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 932 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDEM3Q9BZQ6 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
EDEM3Q9BZQ6 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
EDEM3Q9BZQ6 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
EDEM3Q9BZQ6 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
EDEM3Q9BZQ6 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
EDEM3Q9BZQ6 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
EDEM3Q9BZQ6 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
EDEM3Q9BZQ6 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
EDEM3Q9BZQ6 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
EDEM3Q9BZQ6 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
EDEM3Q9BZQ6 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
EDEM3Q9BZQ6 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
EDEM3Q9BZQ6 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
EDEM3Q9BZQ6 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
EDEM3Q9BZQ6 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
EDEM3Q9BZQ6 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
EDEM3Q9BZQ6 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
EDEM3Q9BZQ6 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
EDEM3Q9BZQ6 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
EDEM3Q9BZQ6 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
EDEM3Q9BZQ6 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
EDEM3Q9BZQ6 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
EDEM3Q9BZQ6 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
EDEM3Q9BZQ6 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
EDEM3Q9BZQ6 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
EDEM3Q9BZQ6 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
EDEM3Q9BZQ6 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
EDEM3Q9BZQ6 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
EDEM3Q9BZQ6 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
EDEM3Q9BZQ6 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
EDEM3Q9BZQ6 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
EDEM3Q9BZQ6 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
EDEM3Q9BZQ6 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
EDEM3Q9BZQ6 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
EDEM3Q9BZQ6 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
EDEM3Q9BZQ6 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
EDEM3Q9BZQ6 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
EDEM3Q9BZQ6 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
EDEM3Q9BZQ6 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
EDEM3Q9BZQ6 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
EDEM3Q9BZQ6 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
EDEM3Q9BZQ6 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
EDEM3Q9BZQ6 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
EDEM3Q9BZQ6 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
EDEM3Q9BZQ6 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
EDEM3Q9BZQ6 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
EDEM3Q9BZQ6 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
EDEM3Q9BZQ6 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
EDEM3Q9BZQ6 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
EDEM3Q9BZQ6 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
EDEM3Q9BZQ6 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
EDEM3Q9BZQ6 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
EDEM3Q9BZQ6 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
EDEM3Q9BZQ6 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
EDEM3Q9BZQ6 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
EDEM3Q9BZQ6 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
EDEM3Q9BZQ6 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
EDEM3Q9BZQ6 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
EDEM3Q9BZQ6 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
EDEM3Q9BZQ6 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
EDEM3Q9BZQ6 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
EDEM3Q9BZQ6 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
EDEM3Q9BZQ6 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
EDEM3Q9BZQ6 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
EDEM3Q9BZQ6 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
EDEM3Q9BZQ6 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
EDEM3Q9BZQ6 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
EDEM3Q9BZQ6 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
EDEM3Q9BZQ6 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
EDEM3Q9BZQ6 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
EDEM3Q9BZQ6 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
EDEM3Q9BZQ6 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
EDEM3Q9BZQ6 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
EDEM3Q9BZQ6 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
EDEM3Q9BZQ6 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
EDEM3Q9BZQ6 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
EDEM3Q9BZQ6 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
EDEM3Q9BZQ6 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
EDEM3Q9BZQ6 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
EDEM3Q9BZQ6 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
EDEM3Q9BZQ6 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
EDEM3Q9BZQ6 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
EDEM3Q9BZQ6 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
EDEM3Q9BZQ6 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
EDEM3Q9BZQ6 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
EDEM3Q9BZQ6 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
EDEM3Q9BZQ6 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
EDEM3Q9BZQ6 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
EDEM3Q9BZQ6 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
EDEM3Q9BZQ6 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
EDEM3Q9BZQ6 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
EDEM3Q9BZQ6 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
EDEM3Q9BZQ6 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
EDEM3Q9BZQ6 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
EDEM3Q9BZQ6 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
EDEM3Q9BZQ6 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
EDEM3Q9BZQ6 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
EDEM3Q9BZQ6 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
EDEM3Q9BZQ6 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
EDEM3Q9BZQ6 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms