Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW9

FANCD2, Fanconi anemia group D2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCD2Q9BXW9 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC41.11■■■■■ 4.17
FANCD2Q9BXW9 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.1■■■■■ 4.17
FANCD2Q9BXW9 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC41.1■■■■■ 4.17
FANCD2Q9BXW9 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC41.09■■■■■ 4.17
FANCD2Q9BXW9 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.09■■■■■ 4.17
FANCD2Q9BXW9 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC41.09■■■■■ 4.17
FANCD2Q9BXW9 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC41.09■■■■■ 4.17
FANCD2Q9BXW9 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC41.09■■■■■ 4.17
FANCD2Q9BXW9 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC41.09■■■■■ 4.17
FANCD2Q9BXW9 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC41.09■■■■■ 4.17
FANCD2Q9BXW9 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC41.08■■■■■ 4.17
FANCD2Q9BXW9 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.08■■■■■ 4.17
FANCD2Q9BXW9 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC41.08■■■■■ 4.17
FANCD2Q9BXW9 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC41.07■■■■■ 4.16
FANCD2Q9BXW9 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC41.06■■■■■ 4.16
FANCD2Q9BXW9 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC41.06■■■■■ 4.16
FANCD2Q9BXW9 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.05■■■■■ 4.16
FANCD2Q9BXW9 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC41.05■■■■■ 4.16
FANCD2Q9BXW9 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.05■■■■■ 4.16
FANCD2Q9BXW9 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC41.05■■■■■ 4.16
FANCD2Q9BXW9 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC41.04■■■■■ 4.16
FANCD2Q9BXW9 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC41.04■■■■■ 4.16
FANCD2Q9BXW9 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.04■■■■■ 4.16
FANCD2Q9BXW9 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.04■■■■■ 4.16
FANCD2Q9BXW9 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.03■■■■■ 4.16
FANCD2Q9BXW9 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC41.03■■■■■ 4.16
FANCD2Q9BXW9 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC41.03■■■■■ 4.16
FANCD2Q9BXW9 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC41.03■■■■■ 4.16
FANCD2Q9BXW9 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.03■■■■■ 4.16
FANCD2Q9BXW9 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC41.02■■■■■ 4.16
FANCD2Q9BXW9 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.02■■■■■ 4.16
FANCD2Q9BXW9 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC41.02■■■■■ 4.16
FANCD2Q9BXW9 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC41.02■■■■■ 4.16
FANCD2Q9BXW9 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.01■■■■■ 4.16
FANCD2Q9BXW9 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.01■■■■■ 4.16
FANCD2Q9BXW9 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC41■■■■■ 4.15
FANCD2Q9BXW9 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC41■■■■■ 4.15
FANCD2Q9BXW9 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.99■■■■■ 4.15
FANCD2Q9BXW9 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.99■■■■■ 4.15
FANCD2Q9BXW9 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.99■■■■■ 4.15
FANCD2Q9BXW9 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.99■■■■■ 4.15
FANCD2Q9BXW9 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC40.99■■■■■ 4.15
FANCD2Q9BXW9 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.99■■■■■ 4.15
FANCD2Q9BXW9 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.98■■■■■ 4.15
FANCD2Q9BXW9 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC40.98■■■■■ 4.15
FANCD2Q9BXW9 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC40.98■■■■■ 4.15
FANCD2Q9BXW9 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC40.98■■■■■ 4.15
FANCD2Q9BXW9 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.98■■■■■ 4.15
FANCD2Q9BXW9 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.98■■■■■ 4.15
FANCD2Q9BXW9 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC40.97■■■■■ 4.15
FANCD2Q9BXW9 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC40.97■■■■■ 4.15
FANCD2Q9BXW9 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC40.97■■■■■ 4.15
FANCD2Q9BXW9 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC40.97■■■■■ 4.15
FANCD2Q9BXW9 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.96■■■■■ 4.15
FANCD2Q9BXW9 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.96■■■■■ 4.15
FANCD2Q9BXW9 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.96■■■■■ 4.15
FANCD2Q9BXW9 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC40.96■■■■■ 4.15
FANCD2Q9BXW9 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.96■■■■■ 4.15
FANCD2Q9BXW9 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC40.96■■■■■ 4.15
FANCD2Q9BXW9 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC40.96■■■■■ 4.15
FANCD2Q9BXW9 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.95■■■■■ 4.15
FANCD2Q9BXW9 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.95■■■■■ 4.15
FANCD2Q9BXW9 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC40.95■■■■■ 4.15
FANCD2Q9BXW9 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC40.94■■■■■ 4.15
FANCD2Q9BXW9 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.94■■■■■ 4.14
FANCD2Q9BXW9 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.94■■■■■ 4.14
FANCD2Q9BXW9 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.94■■■■■ 4.14
FANCD2Q9BXW9 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC40.94■■■■■ 4.14
FANCD2Q9BXW9 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC40.94■■■■■ 4.14
FANCD2Q9BXW9 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.93■■■■■ 4.14
FANCD2Q9BXW9 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC40.93■■■■■ 4.14
FANCD2Q9BXW9 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.93■■■■■ 4.14
FANCD2Q9BXW9 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.92■■■■■ 4.14
FANCD2Q9BXW9 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.92■■■■■ 4.14
FANCD2Q9BXW9 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC40.92■■■■■ 4.14
FANCD2Q9BXW9 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC40.92■■■■■ 4.14
FANCD2Q9BXW9 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.92■■■■■ 4.14
FANCD2Q9BXW9 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.92■■■■■ 4.14
FANCD2Q9BXW9 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.91■■■■■ 4.14
FANCD2Q9BXW9 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC40.91■■■■■ 4.14
FANCD2Q9BXW9 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.91■■■■■ 4.14
FANCD2Q9BXW9 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.9■■■■■ 4.14
FANCD2Q9BXW9 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.9■■■■■ 4.14
FANCD2Q9BXW9 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.9■■■■■ 4.14
FANCD2Q9BXW9 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.9■■■■■ 4.14
FANCD2Q9BXW9 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC40.9■■■■■ 4.14
FANCD2Q9BXW9 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.89■■■■■ 4.14
FANCD2Q9BXW9 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC40.89■■■■■ 4.14
FANCD2Q9BXW9 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC40.89■■■■■ 4.14
FANCD2Q9BXW9 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.88■■■■■ 4.14
FANCD2Q9BXW9 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.88■■■■■ 4.13
FANCD2Q9BXW9 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC40.88■■■■■ 4.13
FANCD2Q9BXW9 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC40.88■■■■■ 4.13
FANCD2Q9BXW9 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC40.87■■■■■ 4.13
FANCD2Q9BXW9 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC40.87■■■■■ 4.13
FANCD2Q9BXW9 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.87■■■■■ 4.13
FANCD2Q9BXW9 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.86■■■■■ 4.13
FANCD2Q9BXW9 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.86■■■■■ 4.13
FANCD2Q9BXW9 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.85■■■■■ 4.13
FANCD2Q9BXW9 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC40.85■■■■■ 4.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms