Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXL8

CDCA4, Cell division cycle-associated protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA4Q9BXL8 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CDCA4Q9BXL8 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CDCA4Q9BXL8 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CDCA4Q9BXL8 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CDCA4Q9BXL8 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CDCA4Q9BXL8 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CDCA4Q9BXL8 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CDCA4Q9BXL8 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CDCA4Q9BXL8 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CDCA4Q9BXL8 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CDCA4Q9BXL8 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CDCA4Q9BXL8 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
CDCA4Q9BXL8 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CDCA4Q9BXL8 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CDCA4Q9BXL8 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CDCA4Q9BXL8 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
CDCA4Q9BXL8 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CDCA4Q9BXL8 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CDCA4Q9BXL8 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
CDCA4Q9BXL8 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CDCA4Q9BXL8 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CDCA4Q9BXL8 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CDCA4Q9BXL8 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CDCA4Q9BXL8 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CDCA4Q9BXL8 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CDCA4Q9BXL8 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CDCA4Q9BXL8 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CDCA4Q9BXL8 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CDCA4Q9BXL8 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CDCA4Q9BXL8 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CDCA4Q9BXL8 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CDCA4Q9BXL8 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CDCA4Q9BXL8 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CDCA4Q9BXL8 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CDCA4Q9BXL8 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CDCA4Q9BXL8 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CDCA4Q9BXL8 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CDCA4Q9BXL8 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CDCA4Q9BXL8 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CDCA4Q9BXL8 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CDCA4Q9BXL8 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CDCA4Q9BXL8 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CDCA4Q9BXL8 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDCA4Q9BXL8 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDCA4Q9BXL8 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDCA4Q9BXL8 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDCA4Q9BXL8 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDCA4Q9BXL8 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDCA4Q9BXL8 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDCA4Q9BXL8 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDCA4Q9BXL8 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDCA4Q9BXL8 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDCA4Q9BXL8 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDCA4Q9BXL8 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDCA4Q9BXL8 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
CDCA4Q9BXL8 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDCA4Q9BXL8 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDCA4Q9BXL8 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDCA4Q9BXL8 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDCA4Q9BXL8 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
CDCA4Q9BXL8 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDCA4Q9BXL8 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDCA4Q9BXL8 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDCA4Q9BXL8 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDCA4Q9BXL8 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CDCA4Q9BXL8 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CDCA4Q9BXL8 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDCA4Q9BXL8 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDCA4Q9BXL8 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDCA4Q9BXL8 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDCA4Q9BXL8 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDCA4Q9BXL8 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDCA4Q9BXL8 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CDCA4Q9BXL8 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDCA4Q9BXL8 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDCA4Q9BXL8 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDCA4Q9BXL8 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDCA4Q9BXL8 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDCA4Q9BXL8 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDCA4Q9BXL8 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDCA4Q9BXL8 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDCA4Q9BXL8 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CDCA4Q9BXL8 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CDCA4Q9BXL8 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CDCA4Q9BXL8 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CDCA4Q9BXL8 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CDCA4Q9BXL8 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CDCA4Q9BXL8 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CDCA4Q9BXL8 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CDCA4Q9BXL8 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CDCA4Q9BXL8 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
CDCA4Q9BXL8 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CDCA4Q9BXL8 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CDCA4Q9BXL8 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CDCA4Q9BXL8 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CDCA4Q9BXL8 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CDCA4Q9BXL8 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CDCA4Q9BXL8 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CDCA4Q9BXL8 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CDCA4Q9BXL8 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms