Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXF6

RAB11FIP5, Rab11 family-interacting protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP5Q9BXF6 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAB11FIP5Q9BXF6 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAB11FIP5Q9BXF6 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAB11FIP5Q9BXF6 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAB11FIP5Q9BXF6 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAB11FIP5Q9BXF6 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAB11FIP5Q9BXF6 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAB11FIP5Q9BXF6 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAB11FIP5Q9BXF6 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
RAB11FIP5Q9BXF6 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAB11FIP5Q9BXF6 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAB11FIP5Q9BXF6 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAB11FIP5Q9BXF6 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAB11FIP5Q9BXF6 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAB11FIP5Q9BXF6 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAB11FIP5Q9BXF6 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAB11FIP5Q9BXF6 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAB11FIP5Q9BXF6 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAB11FIP5Q9BXF6 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAB11FIP5Q9BXF6 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAB11FIP5Q9BXF6 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAB11FIP5Q9BXF6 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RAB11FIP5Q9BXF6 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RAB11FIP5Q9BXF6 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RAB11FIP5Q9BXF6 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RAB11FIP5Q9BXF6 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RAB11FIP5Q9BXF6 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RAB11FIP5Q9BXF6 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAB11FIP5Q9BXF6 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAB11FIP5Q9BXF6 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAB11FIP5Q9BXF6 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAB11FIP5Q9BXF6 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAB11FIP5Q9BXF6 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
RAB11FIP5Q9BXF6 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAB11FIP5Q9BXF6 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAB11FIP5Q9BXF6 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAB11FIP5Q9BXF6 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
RAB11FIP5Q9BXF6 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
RAB11FIP5Q9BXF6 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAB11FIP5Q9BXF6 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAB11FIP5Q9BXF6 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAB11FIP5Q9BXF6 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAB11FIP5Q9BXF6 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAB11FIP5Q9BXF6 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAB11FIP5Q9BXF6 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAB11FIP5Q9BXF6 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAB11FIP5Q9BXF6 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAB11FIP5Q9BXF6 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAB11FIP5Q9BXF6 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAB11FIP5Q9BXF6 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAB11FIP5Q9BXF6 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
RAB11FIP5Q9BXF6 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAB11FIP5Q9BXF6 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAB11FIP5Q9BXF6 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAB11FIP5Q9BXF6 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAB11FIP5Q9BXF6 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAB11FIP5Q9BXF6 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAB11FIP5Q9BXF6 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAB11FIP5Q9BXF6 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAB11FIP5Q9BXF6 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAB11FIP5Q9BXF6 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAB11FIP5Q9BXF6 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAB11FIP5Q9BXF6 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAB11FIP5Q9BXF6 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAB11FIP5Q9BXF6 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAB11FIP5Q9BXF6 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAB11FIP5Q9BXF6 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAB11FIP5Q9BXF6 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAB11FIP5Q9BXF6 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAB11FIP5Q9BXF6 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAB11FIP5Q9BXF6 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAB11FIP5Q9BXF6 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAB11FIP5Q9BXF6 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAB11FIP5Q9BXF6 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAB11FIP5Q9BXF6 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAB11FIP5Q9BXF6 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
RAB11FIP5Q9BXF6 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAB11FIP5Q9BXF6 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAB11FIP5Q9BXF6 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAB11FIP5Q9BXF6 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAB11FIP5Q9BXF6 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
RAB11FIP5Q9BXF6 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAB11FIP5Q9BXF6 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
RAB11FIP5Q9BXF6 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
RAB11FIP5Q9BXF6 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAB11FIP5Q9BXF6 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAB11FIP5Q9BXF6 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAB11FIP5Q9BXF6 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAB11FIP5Q9BXF6 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAB11FIP5Q9BXF6 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAB11FIP5Q9BXF6 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAB11FIP5Q9BXF6 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAB11FIP5Q9BXF6 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAB11FIP5Q9BXF6 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAB11FIP5Q9BXF6 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAB11FIP5Q9BXF6 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAB11FIP5Q9BXF6 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAB11FIP5Q9BXF6 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAB11FIP5Q9BXF6 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAB11FIP5Q9BXF6 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms