Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX74

TM2D1, TM2 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM2D1Q9BX74 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TM2D1Q9BX74 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TM2D1Q9BX74 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TM2D1Q9BX74 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TM2D1Q9BX74 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
TM2D1Q9BX74 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
TM2D1Q9BX74 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
TM2D1Q9BX74 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
TM2D1Q9BX74 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
TM2D1Q9BX74 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
TM2D1Q9BX74 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TM2D1Q9BX74 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TM2D1Q9BX74 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TM2D1Q9BX74 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TM2D1Q9BX74 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TM2D1Q9BX74 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TM2D1Q9BX74 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TM2D1Q9BX74 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
TM2D1Q9BX74 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TM2D1Q9BX74 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TM2D1Q9BX74 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TM2D1Q9BX74 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TM2D1Q9BX74 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TM2D1Q9BX74 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TM2D1Q9BX74 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TM2D1Q9BX74 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TM2D1Q9BX74 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TM2D1Q9BX74 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TM2D1Q9BX74 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TM2D1Q9BX74 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TM2D1Q9BX74 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TM2D1Q9BX74 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TM2D1Q9BX74 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TM2D1Q9BX74 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TM2D1Q9BX74 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TM2D1Q9BX74 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TM2D1Q9BX74 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TM2D1Q9BX74 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TM2D1Q9BX74 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TM2D1Q9BX74 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TM2D1Q9BX74 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TM2D1Q9BX74 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TM2D1Q9BX74 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TM2D1Q9BX74 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TM2D1Q9BX74 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TM2D1Q9BX74 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TM2D1Q9BX74 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TM2D1Q9BX74 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TM2D1Q9BX74 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TM2D1Q9BX74 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TM2D1Q9BX74 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TM2D1Q9BX74 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TM2D1Q9BX74 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TM2D1Q9BX74 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TM2D1Q9BX74 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TM2D1Q9BX74 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TM2D1Q9BX74 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TM2D1Q9BX74 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TM2D1Q9BX74 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TM2D1Q9BX74 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TM2D1Q9BX74 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TM2D1Q9BX74 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TM2D1Q9BX74 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TM2D1Q9BX74 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TM2D1Q9BX74 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TM2D1Q9BX74 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TM2D1Q9BX74 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TM2D1Q9BX74 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TM2D1Q9BX74 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
TM2D1Q9BX74 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TM2D1Q9BX74 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
TM2D1Q9BX74 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
TM2D1Q9BX74 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TM2D1Q9BX74 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TM2D1Q9BX74 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TM2D1Q9BX74 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TM2D1Q9BX74 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TM2D1Q9BX74 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TM2D1Q9BX74 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TM2D1Q9BX74 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TM2D1Q9BX74 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TM2D1Q9BX74 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TM2D1Q9BX74 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TM2D1Q9BX74 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TM2D1Q9BX74 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TM2D1Q9BX74 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TM2D1Q9BX74 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TM2D1Q9BX74 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TM2D1Q9BX74 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TM2D1Q9BX74 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
TM2D1Q9BX74 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TM2D1Q9BX74 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TM2D1Q9BX74 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TM2D1Q9BX74 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TM2D1Q9BX74 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TM2D1Q9BX74 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TM2D1Q9BX74 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TM2D1Q9BX74 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TM2D1Q9BX74 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TM2D1Q9BX74 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms