Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVW6

SMIM2, Small integral membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM2Q9BVW6 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMIM2Q9BVW6 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMIM2Q9BVW6 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMIM2Q9BVW6 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SMIM2Q9BVW6 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SMIM2Q9BVW6 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SMIM2Q9BVW6 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
SMIM2Q9BVW6 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SMIM2Q9BVW6 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SMIM2Q9BVW6 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SMIM2Q9BVW6 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SMIM2Q9BVW6 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SMIM2Q9BVW6 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SMIM2Q9BVW6 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SMIM2Q9BVW6 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SMIM2Q9BVW6 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SMIM2Q9BVW6 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SMIM2Q9BVW6 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SMIM2Q9BVW6 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SMIM2Q9BVW6 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SMIM2Q9BVW6 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SMIM2Q9BVW6 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SMIM2Q9BVW6 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SMIM2Q9BVW6 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SMIM2Q9BVW6 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SMIM2Q9BVW6 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SMIM2Q9BVW6 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SMIM2Q9BVW6 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SMIM2Q9BVW6 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SMIM2Q9BVW6 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SMIM2Q9BVW6 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SMIM2Q9BVW6 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SMIM2Q9BVW6 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SMIM2Q9BVW6 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SMIM2Q9BVW6 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
SMIM2Q9BVW6 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SMIM2Q9BVW6 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
SMIM2Q9BVW6 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SMIM2Q9BVW6 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SMIM2Q9BVW6 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SMIM2Q9BVW6 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SMIM2Q9BVW6 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SMIM2Q9BVW6 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SMIM2Q9BVW6 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SMIM2Q9BVW6 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SMIM2Q9BVW6 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SMIM2Q9BVW6 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SMIM2Q9BVW6 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SMIM2Q9BVW6 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SMIM2Q9BVW6 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SMIM2Q9BVW6 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SMIM2Q9BVW6 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SMIM2Q9BVW6 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SMIM2Q9BVW6 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SMIM2Q9BVW6 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SMIM2Q9BVW6 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SMIM2Q9BVW6 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SMIM2Q9BVW6 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SMIM2Q9BVW6 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SMIM2Q9BVW6 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SMIM2Q9BVW6 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SMIM2Q9BVW6 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SMIM2Q9BVW6 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SMIM2Q9BVW6 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SMIM2Q9BVW6 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SMIM2Q9BVW6 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
SMIM2Q9BVW6 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMIM2Q9BVW6 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMIM2Q9BVW6 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMIM2Q9BVW6 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMIM2Q9BVW6 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMIM2Q9BVW6 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMIM2Q9BVW6 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMIM2Q9BVW6 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMIM2Q9BVW6 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMIM2Q9BVW6 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMIM2Q9BVW6 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMIM2Q9BVW6 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
SMIM2Q9BVW6 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMIM2Q9BVW6 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMIM2Q9BVW6 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMIM2Q9BVW6 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMIM2Q9BVW6 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMIM2Q9BVW6 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMIM2Q9BVW6 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMIM2Q9BVW6 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMIM2Q9BVW6 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMIM2Q9BVW6 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMIM2Q9BVW6 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMIM2Q9BVW6 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMIM2Q9BVW6 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMIM2Q9BVW6 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMIM2Q9BVW6 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMIM2Q9BVW6 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMIM2Q9BVW6 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMIM2Q9BVW6 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMIM2Q9BVW6 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SMIM2Q9BVW6 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMIM2Q9BVW6 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMIM2Q9BVW6 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.3 ms