Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV44

THUMPD3, THUMP domain-containing protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THUMPD3Q9BV44 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
THUMPD3Q9BV44 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
THUMPD3Q9BV44 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
THUMPD3Q9BV44 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
THUMPD3Q9BV44 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
THUMPD3Q9BV44 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
THUMPD3Q9BV44 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
THUMPD3Q9BV44 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
THUMPD3Q9BV44 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
THUMPD3Q9BV44 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
THUMPD3Q9BV44 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
THUMPD3Q9BV44 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
THUMPD3Q9BV44 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
THUMPD3Q9BV44 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
THUMPD3Q9BV44 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
THUMPD3Q9BV44 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
THUMPD3Q9BV44 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
THUMPD3Q9BV44 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
THUMPD3Q9BV44 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
THUMPD3Q9BV44 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
THUMPD3Q9BV44 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
THUMPD3Q9BV44 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
THUMPD3Q9BV44 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
THUMPD3Q9BV44 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
THUMPD3Q9BV44 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
THUMPD3Q9BV44 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
THUMPD3Q9BV44 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
THUMPD3Q9BV44 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
THUMPD3Q9BV44 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
THUMPD3Q9BV44 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
THUMPD3Q9BV44 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
THUMPD3Q9BV44 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
THUMPD3Q9BV44 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
THUMPD3Q9BV44 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
THUMPD3Q9BV44 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
THUMPD3Q9BV44 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
THUMPD3Q9BV44 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
THUMPD3Q9BV44 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
THUMPD3Q9BV44 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
THUMPD3Q9BV44 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
THUMPD3Q9BV44 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
THUMPD3Q9BV44 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
THUMPD3Q9BV44 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
THUMPD3Q9BV44 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
THUMPD3Q9BV44 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
THUMPD3Q9BV44 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
THUMPD3Q9BV44 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
THUMPD3Q9BV44 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
THUMPD3Q9BV44 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
THUMPD3Q9BV44 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
THUMPD3Q9BV44 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
THUMPD3Q9BV44 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
THUMPD3Q9BV44 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
THUMPD3Q9BV44 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
THUMPD3Q9BV44 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
THUMPD3Q9BV44 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
THUMPD3Q9BV44 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
THUMPD3Q9BV44 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
THUMPD3Q9BV44 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
THUMPD3Q9BV44 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
THUMPD3Q9BV44 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
THUMPD3Q9BV44 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
THUMPD3Q9BV44 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
THUMPD3Q9BV44 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
THUMPD3Q9BV44 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
THUMPD3Q9BV44 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
THUMPD3Q9BV44 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
THUMPD3Q9BV44 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
THUMPD3Q9BV44 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
THUMPD3Q9BV44 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
THUMPD3Q9BV44 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
THUMPD3Q9BV44 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
THUMPD3Q9BV44 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
THUMPD3Q9BV44 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
THUMPD3Q9BV44 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
THUMPD3Q9BV44 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
THUMPD3Q9BV44 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
THUMPD3Q9BV44 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
THUMPD3Q9BV44 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
THUMPD3Q9BV44 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
THUMPD3Q9BV44 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
THUMPD3Q9BV44 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
THUMPD3Q9BV44 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
THUMPD3Q9BV44 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
THUMPD3Q9BV44 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
THUMPD3Q9BV44 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
THUMPD3Q9BV44 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
THUMPD3Q9BV44 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
THUMPD3Q9BV44 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
THUMPD3Q9BV44 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
THUMPD3Q9BV44 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
THUMPD3Q9BV44 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
THUMPD3Q9BV44 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
THUMPD3Q9BV44 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
THUMPD3Q9BV44 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
THUMPD3Q9BV44 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
THUMPD3Q9BV44 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
THUMPD3Q9BV44 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
THUMPD3Q9BV44 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
THUMPD3Q9BV44 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms