Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTT6

LRRC1, Leucine-rich repeat-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC1Q9BTT6 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LRRC1Q9BTT6 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LRRC1Q9BTT6 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LRRC1Q9BTT6 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LRRC1Q9BTT6 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LRRC1Q9BTT6 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LRRC1Q9BTT6 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LRRC1Q9BTT6 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LRRC1Q9BTT6 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
LRRC1Q9BTT6 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
LRRC1Q9BTT6 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
LRRC1Q9BTT6 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
LRRC1Q9BTT6 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
LRRC1Q9BTT6 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LRRC1Q9BTT6 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LRRC1Q9BTT6 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
LRRC1Q9BTT6 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
LRRC1Q9BTT6 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LRRC1Q9BTT6 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
LRRC1Q9BTT6 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
LRRC1Q9BTT6 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
LRRC1Q9BTT6 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
LRRC1Q9BTT6 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LRRC1Q9BTT6 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
LRRC1Q9BTT6 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LRRC1Q9BTT6 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
LRRC1Q9BTT6 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
LRRC1Q9BTT6 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LRRC1Q9BTT6 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LRRC1Q9BTT6 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LRRC1Q9BTT6 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LRRC1Q9BTT6 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LRRC1Q9BTT6 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LRRC1Q9BTT6 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LRRC1Q9BTT6 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LRRC1Q9BTT6 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LRRC1Q9BTT6 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LRRC1Q9BTT6 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
LRRC1Q9BTT6 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LRRC1Q9BTT6 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LRRC1Q9BTT6 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LRRC1Q9BTT6 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRRC1Q9BTT6 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRRC1Q9BTT6 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRRC1Q9BTT6 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
LRRC1Q9BTT6 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRRC1Q9BTT6 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRRC1Q9BTT6 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRRC1Q9BTT6 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRRC1Q9BTT6 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRRC1Q9BTT6 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRRC1Q9BTT6 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LRRC1Q9BTT6 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LRRC1Q9BTT6 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LRRC1Q9BTT6 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LRRC1Q9BTT6 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LRRC1Q9BTT6 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LRRC1Q9BTT6 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRRC1Q9BTT6 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRRC1Q9BTT6 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRRC1Q9BTT6 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRRC1Q9BTT6 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRRC1Q9BTT6 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRRC1Q9BTT6 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRRC1Q9BTT6 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRRC1Q9BTT6 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRRC1Q9BTT6 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRRC1Q9BTT6 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRRC1Q9BTT6 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRRC1Q9BTT6 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRRC1Q9BTT6 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRRC1Q9BTT6 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRRC1Q9BTT6 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRRC1Q9BTT6 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRRC1Q9BTT6 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRRC1Q9BTT6 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRRC1Q9BTT6 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRRC1Q9BTT6 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRRC1Q9BTT6 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRRC1Q9BTT6 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRRC1Q9BTT6 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRRC1Q9BTT6 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRRC1Q9BTT6 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRRC1Q9BTT6 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRRC1Q9BTT6 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRRC1Q9BTT6 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRRC1Q9BTT6 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRRC1Q9BTT6 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRRC1Q9BTT6 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRRC1Q9BTT6 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
LRRC1Q9BTT6 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRRC1Q9BTT6 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRRC1Q9BTT6 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LRRC1Q9BTT6 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LRRC1Q9BTT6 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LRRC1Q9BTT6 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LRRC1Q9BTT6 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LRRC1Q9BTT6 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LRRC1Q9BTT6 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LRRC1Q9BTT6 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms