Protein–RNA interactions for Protein: Q9BS16

CENPK, Centromere protein K, humanhuman

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPKQ9BS16 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CENPKQ9BS16 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CENPKQ9BS16 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CENPKQ9BS16 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CENPKQ9BS16 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CENPKQ9BS16 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CENPKQ9BS16 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CENPKQ9BS16 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CENPKQ9BS16 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CENPKQ9BS16 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CENPKQ9BS16 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CENPKQ9BS16 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CENPKQ9BS16 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CENPKQ9BS16 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CENPKQ9BS16 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CENPKQ9BS16 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CENPKQ9BS16 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CENPKQ9BS16 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CENPKQ9BS16 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CENPKQ9BS16 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CENPKQ9BS16 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CENPKQ9BS16 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CENPKQ9BS16 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CENPKQ9BS16 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CENPKQ9BS16 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CENPKQ9BS16 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CENPKQ9BS16 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CENPKQ9BS16 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CENPKQ9BS16 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CENPKQ9BS16 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CENPKQ9BS16 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CENPKQ9BS16 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CENPKQ9BS16 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CENPKQ9BS16 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CENPKQ9BS16 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CENPKQ9BS16 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CENPKQ9BS16 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CENPKQ9BS16 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CENPKQ9BS16 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CENPKQ9BS16 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CENPKQ9BS16 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CENPKQ9BS16 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CENPKQ9BS16 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CENPKQ9BS16 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CENPKQ9BS16 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CENPKQ9BS16 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CENPKQ9BS16 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CENPKQ9BS16 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CENPKQ9BS16 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CENPKQ9BS16 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CENPKQ9BS16 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CENPKQ9BS16 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CENPKQ9BS16 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CENPKQ9BS16 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CENPKQ9BS16 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CENPKQ9BS16 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CENPKQ9BS16 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CENPKQ9BS16 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CENPKQ9BS16 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CENPKQ9BS16 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CENPKQ9BS16 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CENPKQ9BS16 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CENPKQ9BS16 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CENPKQ9BS16 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CENPKQ9BS16 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CENPKQ9BS16 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CENPKQ9BS16 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CENPKQ9BS16 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CENPKQ9BS16 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CENPKQ9BS16 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CENPKQ9BS16 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CENPKQ9BS16 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CENPKQ9BS16 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CENPKQ9BS16 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CENPKQ9BS16 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CENPKQ9BS16 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CENPKQ9BS16 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CENPKQ9BS16 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CENPKQ9BS16 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CENPKQ9BS16 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CENPKQ9BS16 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CENPKQ9BS16 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CENPKQ9BS16 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CENPKQ9BS16 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CENPKQ9BS16 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CENPKQ9BS16 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
CENPKQ9BS16 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CENPKQ9BS16 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CENPKQ9BS16 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CENPKQ9BS16 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CENPKQ9BS16 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CENPKQ9BS16 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CENPKQ9BS16 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CENPKQ9BS16 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CENPKQ9BS16 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CENPKQ9BS16 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CENPKQ9BS16 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CENPKQ9BS16 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CENPKQ9BS16 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CENPKQ9BS16 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms