Protein–RNA interactions for Protein: Q9BR11

ZSWIM1, Zinc finger SWIM domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZSWIM1Q9BR11 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZSWIM1Q9BR11 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZSWIM1Q9BR11 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZSWIM1Q9BR11 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZSWIM1Q9BR11 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZSWIM1Q9BR11 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZSWIM1Q9BR11 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZSWIM1Q9BR11 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZSWIM1Q9BR11 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZSWIM1Q9BR11 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZSWIM1Q9BR11 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZSWIM1Q9BR11 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZSWIM1Q9BR11 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZSWIM1Q9BR11 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZSWIM1Q9BR11 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZSWIM1Q9BR11 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZSWIM1Q9BR11 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
ZSWIM1Q9BR11 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZSWIM1Q9BR11 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZSWIM1Q9BR11 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZSWIM1Q9BR11 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZSWIM1Q9BR11 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZSWIM1Q9BR11 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZSWIM1Q9BR11 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
ZSWIM1Q9BR11 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
ZSWIM1Q9BR11 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZSWIM1Q9BR11 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZSWIM1Q9BR11 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
ZSWIM1Q9BR11 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ZSWIM1Q9BR11 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ZSWIM1Q9BR11 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ZSWIM1Q9BR11 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
ZSWIM1Q9BR11 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ZSWIM1Q9BR11 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ZSWIM1Q9BR11 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ZSWIM1Q9BR11 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ZSWIM1Q9BR11 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ZSWIM1Q9BR11 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ZSWIM1Q9BR11 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ZSWIM1Q9BR11 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ZSWIM1Q9BR11 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZSWIM1Q9BR11 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZSWIM1Q9BR11 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZSWIM1Q9BR11 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZSWIM1Q9BR11 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZSWIM1Q9BR11 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZSWIM1Q9BR11 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZSWIM1Q9BR11 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZSWIM1Q9BR11 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ZSWIM1Q9BR11 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ZSWIM1Q9BR11 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ZSWIM1Q9BR11 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ZSWIM1Q9BR11 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ZSWIM1Q9BR11 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZSWIM1Q9BR11 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZSWIM1Q9BR11 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZSWIM1Q9BR11 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZSWIM1Q9BR11 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZSWIM1Q9BR11 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZSWIM1Q9BR11 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZSWIM1Q9BR11 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZSWIM1Q9BR11 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZSWIM1Q9BR11 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZSWIM1Q9BR11 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ZSWIM1Q9BR11 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ZSWIM1Q9BR11 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
ZSWIM1Q9BR11 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ZSWIM1Q9BR11 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ZSWIM1Q9BR11 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ZSWIM1Q9BR11 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ZSWIM1Q9BR11 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
ZSWIM1Q9BR11 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ZSWIM1Q9BR11 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ZSWIM1Q9BR11 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ZSWIM1Q9BR11 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ZSWIM1Q9BR11 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ZSWIM1Q9BR11 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ZSWIM1Q9BR11 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ZSWIM1Q9BR11 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ZSWIM1Q9BR11 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
ZSWIM1Q9BR11 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ZSWIM1Q9BR11 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
ZSWIM1Q9BR11 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
ZSWIM1Q9BR11 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ZSWIM1Q9BR11 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ZSWIM1Q9BR11 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ZSWIM1Q9BR11 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ZSWIM1Q9BR11 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ZSWIM1Q9BR11 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ZSWIM1Q9BR11 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ZSWIM1Q9BR11 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ZSWIM1Q9BR11 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ZSWIM1Q9BR11 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ZSWIM1Q9BR11 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ZSWIM1Q9BR11 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ZSWIM1Q9BR11 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ZSWIM1Q9BR11 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ZSWIM1Q9BR11 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ZSWIM1Q9BR11 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ZSWIM1Q9BR11 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms