Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQY4

RHOXF2, Rhox homeobox family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOXF2Q9BQY4 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RHOXF2Q9BQY4 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RHOXF2Q9BQY4 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RHOXF2Q9BQY4 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RHOXF2Q9BQY4 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RHOXF2Q9BQY4 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RHOXF2Q9BQY4 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RHOXF2Q9BQY4 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RHOXF2Q9BQY4 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RHOXF2Q9BQY4 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RHOXF2Q9BQY4 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RHOXF2Q9BQY4 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RHOXF2Q9BQY4 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RHOXF2Q9BQY4 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RHOXF2Q9BQY4 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RHOXF2Q9BQY4 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RHOXF2Q9BQY4 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
RHOXF2Q9BQY4 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RHOXF2Q9BQY4 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RHOXF2Q9BQY4 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RHOXF2Q9BQY4 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RHOXF2Q9BQY4 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RHOXF2Q9BQY4 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RHOXF2Q9BQY4 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RHOXF2Q9BQY4 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RHOXF2Q9BQY4 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RHOXF2Q9BQY4 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
RHOXF2Q9BQY4 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RHOXF2Q9BQY4 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RHOXF2Q9BQY4 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RHOXF2Q9BQY4 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RHOXF2Q9BQY4 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RHOXF2Q9BQY4 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RHOXF2Q9BQY4 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RHOXF2Q9BQY4 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
RHOXF2Q9BQY4 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RHOXF2Q9BQY4 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
RHOXF2Q9BQY4 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RHOXF2Q9BQY4 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RHOXF2Q9BQY4 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RHOXF2Q9BQY4 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RHOXF2Q9BQY4 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RHOXF2Q9BQY4 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RHOXF2Q9BQY4 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RHOXF2Q9BQY4 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RHOXF2Q9BQY4 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RHOXF2Q9BQY4 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RHOXF2Q9BQY4 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RHOXF2Q9BQY4 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RHOXF2Q9BQY4 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RHOXF2Q9BQY4 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RHOXF2Q9BQY4 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RHOXF2Q9BQY4 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RHOXF2Q9BQY4 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RHOXF2Q9BQY4 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RHOXF2Q9BQY4 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RHOXF2Q9BQY4 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RHOXF2Q9BQY4 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RHOXF2Q9BQY4 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RHOXF2Q9BQY4 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RHOXF2Q9BQY4 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RHOXF2Q9BQY4 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RHOXF2Q9BQY4 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RHOXF2Q9BQY4 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RHOXF2Q9BQY4 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RHOXF2Q9BQY4 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RHOXF2Q9BQY4 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RHOXF2Q9BQY4 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RHOXF2Q9BQY4 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RHOXF2Q9BQY4 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RHOXF2Q9BQY4 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RHOXF2Q9BQY4 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RHOXF2Q9BQY4 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RHOXF2Q9BQY4 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RHOXF2Q9BQY4 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RHOXF2Q9BQY4 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RHOXF2Q9BQY4 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RHOXF2Q9BQY4 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RHOXF2Q9BQY4 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RHOXF2Q9BQY4 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RHOXF2Q9BQY4 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RHOXF2Q9BQY4 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RHOXF2Q9BQY4 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RHOXF2Q9BQY4 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RHOXF2Q9BQY4 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RHOXF2Q9BQY4 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RHOXF2Q9BQY4 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RHOXF2Q9BQY4 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RHOXF2Q9BQY4 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RHOXF2Q9BQY4 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
RHOXF2Q9BQY4 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RHOXF2Q9BQY4 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RHOXF2Q9BQY4 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RHOXF2Q9BQY4 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RHOXF2Q9BQY4 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RHOXF2Q9BQY4 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RHOXF2Q9BQY4 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RHOXF2Q9BQY4 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RHOXF2Q9BQY4 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RHOXF2Q9BQY4 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms