Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ50

TREX2, Three prime repair exonuclease 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREX2Q9BQ50 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TREX2Q9BQ50 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TREX2Q9BQ50 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TREX2Q9BQ50 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TREX2Q9BQ50 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TREX2Q9BQ50 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TREX2Q9BQ50 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TREX2Q9BQ50 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TREX2Q9BQ50 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TREX2Q9BQ50 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TREX2Q9BQ50 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TREX2Q9BQ50 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TREX2Q9BQ50 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TREX2Q9BQ50 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TREX2Q9BQ50 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TREX2Q9BQ50 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TREX2Q9BQ50 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TREX2Q9BQ50 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TREX2Q9BQ50 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TREX2Q9BQ50 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TREX2Q9BQ50 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TREX2Q9BQ50 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TREX2Q9BQ50 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TREX2Q9BQ50 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TREX2Q9BQ50 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TREX2Q9BQ50 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TREX2Q9BQ50 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TREX2Q9BQ50 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TREX2Q9BQ50 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TREX2Q9BQ50 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TREX2Q9BQ50 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TREX2Q9BQ50 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TREX2Q9BQ50 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TREX2Q9BQ50 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TREX2Q9BQ50 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TREX2Q9BQ50 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TREX2Q9BQ50 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TREX2Q9BQ50 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TREX2Q9BQ50 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TREX2Q9BQ50 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TREX2Q9BQ50 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TREX2Q9BQ50 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TREX2Q9BQ50 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TREX2Q9BQ50 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TREX2Q9BQ50 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TREX2Q9BQ50 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TREX2Q9BQ50 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TREX2Q9BQ50 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TREX2Q9BQ50 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TREX2Q9BQ50 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TREX2Q9BQ50 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TREX2Q9BQ50 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TREX2Q9BQ50 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TREX2Q9BQ50 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TREX2Q9BQ50 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TREX2Q9BQ50 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
TREX2Q9BQ50 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
TREX2Q9BQ50 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TREX2Q9BQ50 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TREX2Q9BQ50 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TREX2Q9BQ50 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TREX2Q9BQ50 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TREX2Q9BQ50 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TREX2Q9BQ50 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TREX2Q9BQ50 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TREX2Q9BQ50 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TREX2Q9BQ50 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TREX2Q9BQ50 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TREX2Q9BQ50 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TREX2Q9BQ50 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TREX2Q9BQ50 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TREX2Q9BQ50 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TREX2Q9BQ50 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TREX2Q9BQ50 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TREX2Q9BQ50 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TREX2Q9BQ50 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TREX2Q9BQ50 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TREX2Q9BQ50 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TREX2Q9BQ50 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TREX2Q9BQ50 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TREX2Q9BQ50 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TREX2Q9BQ50 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TREX2Q9BQ50 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TREX2Q9BQ50 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TREX2Q9BQ50 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TREX2Q9BQ50 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TREX2Q9BQ50 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TREX2Q9BQ50 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TREX2Q9BQ50 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TREX2Q9BQ50 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TREX2Q9BQ50 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TREX2Q9BQ50 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TREX2Q9BQ50 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TREX2Q9BQ50 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TREX2Q9BQ50 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TREX2Q9BQ50 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TREX2Q9BQ50 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
TREX2Q9BQ50 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TREX2Q9BQ50 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TREX2Q9BQ50 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.8 ms