Protein–RNA interactions for Protein: Q9BPX3

NCAPG, Condensin complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,015 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPGQ9BPX3 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NCAPGQ9BPX3 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NCAPGQ9BPX3 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NCAPGQ9BPX3 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NCAPGQ9BPX3 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NCAPGQ9BPX3 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NCAPGQ9BPX3 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NCAPGQ9BPX3 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NCAPGQ9BPX3 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NCAPGQ9BPX3 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NCAPGQ9BPX3 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NCAPGQ9BPX3 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NCAPGQ9BPX3 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NCAPGQ9BPX3 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NCAPGQ9BPX3 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NCAPGQ9BPX3 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NCAPGQ9BPX3 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NCAPGQ9BPX3 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NCAPGQ9BPX3 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NCAPGQ9BPX3 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NCAPGQ9BPX3 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NCAPGQ9BPX3 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NCAPGQ9BPX3 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NCAPGQ9BPX3 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NCAPGQ9BPX3 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NCAPGQ9BPX3 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NCAPGQ9BPX3 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NCAPGQ9BPX3 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NCAPGQ9BPX3 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NCAPGQ9BPX3 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NCAPGQ9BPX3 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NCAPGQ9BPX3 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
NCAPGQ9BPX3 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NCAPGQ9BPX3 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NCAPGQ9BPX3 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NCAPGQ9BPX3 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NCAPGQ9BPX3 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NCAPGQ9BPX3 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NCAPGQ9BPX3 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
NCAPGQ9BPX3 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NCAPGQ9BPX3 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NCAPGQ9BPX3 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NCAPGQ9BPX3 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NCAPGQ9BPX3 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NCAPGQ9BPX3 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NCAPGQ9BPX3 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NCAPGQ9BPX3 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NCAPGQ9BPX3 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NCAPGQ9BPX3 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NCAPGQ9BPX3 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
NCAPGQ9BPX3 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NCAPGQ9BPX3 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NCAPGQ9BPX3 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NCAPGQ9BPX3 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NCAPGQ9BPX3 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
NCAPGQ9BPX3 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NCAPGQ9BPX3 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NCAPGQ9BPX3 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NCAPGQ9BPX3 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NCAPGQ9BPX3 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NCAPGQ9BPX3 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NCAPGQ9BPX3 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NCAPGQ9BPX3 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NCAPGQ9BPX3 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NCAPGQ9BPX3 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NCAPGQ9BPX3 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NCAPGQ9BPX3 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NCAPGQ9BPX3 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NCAPGQ9BPX3 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NCAPGQ9BPX3 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NCAPGQ9BPX3 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
NCAPGQ9BPX3 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NCAPGQ9BPX3 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NCAPGQ9BPX3 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NCAPGQ9BPX3 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NCAPGQ9BPX3 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
NCAPGQ9BPX3 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NCAPGQ9BPX3 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NCAPGQ9BPX3 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NCAPGQ9BPX3 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NCAPGQ9BPX3 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NCAPGQ9BPX3 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NCAPGQ9BPX3 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
NCAPGQ9BPX3 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NCAPGQ9BPX3 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
NCAPGQ9BPX3 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NCAPGQ9BPX3 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NCAPGQ9BPX3 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NCAPGQ9BPX3 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NCAPGQ9BPX3 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NCAPGQ9BPX3 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NCAPGQ9BPX3 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NCAPGQ9BPX3 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NCAPGQ9BPX3 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NCAPGQ9BPX3 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NCAPGQ9BPX3 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NCAPGQ9BPX3 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
NCAPGQ9BPX3 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NCAPGQ9BPX3 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NCAPGQ9BPX3 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 165.5 ms