Protein–RNA interactions for Protein: Q99708

RBBP8, DNA endonuclease RBBP8, humanhuman

Predictions only

Length 897 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP8Q99708 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RBBP8Q99708 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RBBP8Q99708 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RBBP8Q99708 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RBBP8Q99708 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RBBP8Q99708 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RBBP8Q99708 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RBBP8Q99708 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RBBP8Q99708 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RBBP8Q99708 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RBBP8Q99708 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RBBP8Q99708 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
RBBP8Q99708 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
RBBP8Q99708 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RBBP8Q99708 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RBBP8Q99708 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RBBP8Q99708 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RBBP8Q99708 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RBBP8Q99708 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RBBP8Q99708 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RBBP8Q99708 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RBBP8Q99708 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RBBP8Q99708 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RBBP8Q99708 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RBBP8Q99708 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RBBP8Q99708 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RBBP8Q99708 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RBBP8Q99708 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RBBP8Q99708 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RBBP8Q99708 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RBBP8Q99708 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RBBP8Q99708 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RBBP8Q99708 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RBBP8Q99708 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RBBP8Q99708 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RBBP8Q99708 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RBBP8Q99708 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RBBP8Q99708 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RBBP8Q99708 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RBBP8Q99708 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RBBP8Q99708 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RBBP8Q99708 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RBBP8Q99708 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RBBP8Q99708 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RBBP8Q99708 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RBBP8Q99708 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RBBP8Q99708 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
RBBP8Q99708 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RBBP8Q99708 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RBBP8Q99708 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RBBP8Q99708 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RBBP8Q99708 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RBBP8Q99708 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.35
RBBP8Q99708 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RBBP8Q99708 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RBBP8Q99708 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RBBP8Q99708 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RBBP8Q99708 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RBBP8Q99708 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RBBP8Q99708 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RBBP8Q99708 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RBBP8Q99708 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RBBP8Q99708 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RBBP8Q99708 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RBBP8Q99708 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RBBP8Q99708 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RBBP8Q99708 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RBBP8Q99708 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RBBP8Q99708 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RBBP8Q99708 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
RBBP8Q99708 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RBBP8Q99708 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RBBP8Q99708 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RBBP8Q99708 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RBBP8Q99708 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RBBP8Q99708 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RBBP8Q99708 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RBBP8Q99708 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RBBP8Q99708 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RBBP8Q99708 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RBBP8Q99708 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RBBP8Q99708 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RBBP8Q99708 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RBBP8Q99708 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RBBP8Q99708 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RBBP8Q99708 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RBBP8Q99708 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RBBP8Q99708 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RBBP8Q99708 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RBBP8Q99708 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.35
RBBP8Q99708 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RBBP8Q99708 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RBBP8Q99708 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RBBP8Q99708 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RBBP8Q99708 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
RBBP8Q99708 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RBBP8Q99708 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RBBP8Q99708 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RBBP8Q99708 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RBBP8Q99708 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms