Protein–RNA interactions for Protein: Q99519

NEU1, Sialidase-1, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEU1Q99519 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NEU1Q99519 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NEU1Q99519 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NEU1Q99519 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NEU1Q99519 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NEU1Q99519 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NEU1Q99519 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NEU1Q99519 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NEU1Q99519 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NEU1Q99519 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NEU1Q99519 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NEU1Q99519 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NEU1Q99519 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NEU1Q99519 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NEU1Q99519 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NEU1Q99519 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NEU1Q99519 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NEU1Q99519 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NEU1Q99519 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NEU1Q99519 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NEU1Q99519 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NEU1Q99519 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NEU1Q99519 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NEU1Q99519 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NEU1Q99519 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NEU1Q99519 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NEU1Q99519 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NEU1Q99519 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NEU1Q99519 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NEU1Q99519 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NEU1Q99519 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NEU1Q99519 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NEU1Q99519 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NEU1Q99519 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NEU1Q99519 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NEU1Q99519 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NEU1Q99519 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NEU1Q99519 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NEU1Q99519 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NEU1Q99519 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NEU1Q99519 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NEU1Q99519 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NEU1Q99519 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NEU1Q99519 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NEU1Q99519 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NEU1Q99519 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NEU1Q99519 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NEU1Q99519 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NEU1Q99519 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NEU1Q99519 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NEU1Q99519 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NEU1Q99519 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NEU1Q99519 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NEU1Q99519 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
NEU1Q99519 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NEU1Q99519 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NEU1Q99519 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NEU1Q99519 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NEU1Q99519 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NEU1Q99519 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NEU1Q99519 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NEU1Q99519 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NEU1Q99519 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NEU1Q99519 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NEU1Q99519 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NEU1Q99519 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NEU1Q99519 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NEU1Q99519 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NEU1Q99519 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NEU1Q99519 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NEU1Q99519 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NEU1Q99519 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NEU1Q99519 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NEU1Q99519 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NEU1Q99519 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NEU1Q99519 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NEU1Q99519 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NEU1Q99519 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NEU1Q99519 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NEU1Q99519 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NEU1Q99519 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NEU1Q99519 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NEU1Q99519 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NEU1Q99519 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NEU1Q99519 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NEU1Q99519 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NEU1Q99519 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NEU1Q99519 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NEU1Q99519 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NEU1Q99519 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NEU1Q99519 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NEU1Q99519 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NEU1Q99519 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NEU1Q99519 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NEU1Q99519 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NEU1Q99519 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NEU1Q99519 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NEU1Q99519 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NEU1Q99519 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NEU1Q99519 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms