Protein–RNA interactions for Protein: Q99504

EYA3, Eyes absent homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 573 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EYA3Q99504 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
EYA3Q99504 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
EYA3Q99504 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
EYA3Q99504 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
EYA3Q99504 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
EYA3Q99504 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
EYA3Q99504 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
EYA3Q99504 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
EYA3Q99504 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
EYA3Q99504 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
EYA3Q99504 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
EYA3Q99504 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
EYA3Q99504 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
EYA3Q99504 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
EYA3Q99504 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC29.02■■■□□ 2.24
EYA3Q99504 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
EYA3Q99504 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.24
EYA3Q99504 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
EYA3Q99504 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
EYA3Q99504 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC29■■■□□ 2.23
EYA3Q99504 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
EYA3Q99504 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
EYA3Q99504 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
EYA3Q99504 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
EYA3Q99504 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
EYA3Q99504 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
EYA3Q99504 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
EYA3Q99504 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
EYA3Q99504 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
EYA3Q99504 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
EYA3Q99504 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
EYA3Q99504 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
EYA3Q99504 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
EYA3Q99504 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC28.98■■■□□ 2.23
EYA3Q99504 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
EYA3Q99504 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
EYA3Q99504 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
EYA3Q99504 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
EYA3Q99504 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC28.97■■■□□ 2.23
EYA3Q99504 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
EYA3Q99504 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
EYA3Q99504 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
EYA3Q99504 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
EYA3Q99504 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
EYA3Q99504 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
EYA3Q99504 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
EYA3Q99504 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
EYA3Q99504 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
EYA3Q99504 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
EYA3Q99504 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
EYA3Q99504 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
EYA3Q99504 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
EYA3Q99504 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
EYA3Q99504 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
EYA3Q99504 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
EYA3Q99504 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
EYA3Q99504 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
EYA3Q99504 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
EYA3Q99504 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
EYA3Q99504 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
EYA3Q99504 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
EYA3Q99504 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
EYA3Q99504 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
EYA3Q99504 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
EYA3Q99504 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
EYA3Q99504 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
EYA3Q99504 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
EYA3Q99504 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
EYA3Q99504 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
EYA3Q99504 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
EYA3Q99504 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
EYA3Q99504 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
EYA3Q99504 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
EYA3Q99504 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
EYA3Q99504 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
EYA3Q99504 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
EYA3Q99504 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
EYA3Q99504 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
EYA3Q99504 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
EYA3Q99504 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
EYA3Q99504 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
EYA3Q99504 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
EYA3Q99504 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
EYA3Q99504 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
EYA3Q99504 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
EYA3Q99504 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
EYA3Q99504 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
EYA3Q99504 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
EYA3Q99504 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
EYA3Q99504 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
EYA3Q99504 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
EYA3Q99504 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
EYA3Q99504 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
EYA3Q99504 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
EYA3Q99504 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
EYA3Q99504 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
EYA3Q99504 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC28.84■■■□□ 2.21
EYA3Q99504 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
EYA3Q99504 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
EYA3Q99504 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.6 ms