Protein–RNA interactions for Protein: Q99456

KRT12, Keratin, type I cytoskeletal 12, humanhuman

Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT12Q99456 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
KRT12Q99456 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
KRT12Q99456 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
KRT12Q99456 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
KRT12Q99456 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
KRT12Q99456 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
KRT12Q99456 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
KRT12Q99456 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
KRT12Q99456 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KRT12Q99456 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KRT12Q99456 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
KRT12Q99456 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
KRT12Q99456 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
KRT12Q99456 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KRT12Q99456 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KRT12Q99456 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KRT12Q99456 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
KRT12Q99456 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KRT12Q99456 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
KRT12Q99456 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
KRT12Q99456 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KRT12Q99456 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
KRT12Q99456 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KRT12Q99456 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
KRT12Q99456 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KRT12Q99456 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
KRT12Q99456 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
KRT12Q99456 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KRT12Q99456 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
KRT12Q99456 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
KRT12Q99456 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KRT12Q99456 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
KRT12Q99456 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
KRT12Q99456 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KRT12Q99456 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KRT12Q99456 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KRT12Q99456 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KRT12Q99456 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
KRT12Q99456 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KRT12Q99456 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KRT12Q99456 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KRT12Q99456 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KRT12Q99456 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KRT12Q99456 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KRT12Q99456 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KRT12Q99456 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KRT12Q99456 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KRT12Q99456 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
KRT12Q99456 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
KRT12Q99456 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
KRT12Q99456 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
KRT12Q99456 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
KRT12Q99456 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
KRT12Q99456 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
KRT12Q99456 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
KRT12Q99456 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KRT12Q99456 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KRT12Q99456 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KRT12Q99456 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KRT12Q99456 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
KRT12Q99456 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KRT12Q99456 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
KRT12Q99456 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KRT12Q99456 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
KRT12Q99456 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KRT12Q99456 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
KRT12Q99456 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
KRT12Q99456 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KRT12Q99456 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KRT12Q99456 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
KRT12Q99456 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KRT12Q99456 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KRT12Q99456 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KRT12Q99456 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KRT12Q99456 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KRT12Q99456 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KRT12Q99456 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KRT12Q99456 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KRT12Q99456 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KRT12Q99456 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KRT12Q99456 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KRT12Q99456 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KRT12Q99456 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KRT12Q99456 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KRT12Q99456 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KRT12Q99456 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KRT12Q99456 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KRT12Q99456 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KRT12Q99456 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KRT12Q99456 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KRT12Q99456 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KRT12Q99456 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KRT12Q99456 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KRT12Q99456 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KRT12Q99456 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KRT12Q99456 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KRT12Q99456 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KRT12Q99456 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KRT12Q99456 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KRT12Q99456 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms