Protein–RNA interactions for Protein: Q96SI9

STRBP, Spermatid perinuclear RNA-binding protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 672 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRBPQ96SI9 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
STRBPQ96SI9 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
STRBPQ96SI9 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
STRBPQ96SI9 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
STRBPQ96SI9 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
STRBPQ96SI9 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
STRBPQ96SI9 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
STRBPQ96SI9 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
STRBPQ96SI9 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
STRBPQ96SI9 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
STRBPQ96SI9 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
STRBPQ96SI9 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
STRBPQ96SI9 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
STRBPQ96SI9 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
STRBPQ96SI9 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
STRBPQ96SI9 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
STRBPQ96SI9 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
STRBPQ96SI9 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
STRBPQ96SI9 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
STRBPQ96SI9 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
STRBPQ96SI9 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
STRBPQ96SI9 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
STRBPQ96SI9 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
STRBPQ96SI9 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
STRBPQ96SI9 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
STRBPQ96SI9 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
STRBPQ96SI9 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
STRBPQ96SI9 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
STRBPQ96SI9 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
STRBPQ96SI9 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
STRBPQ96SI9 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
STRBPQ96SI9 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
STRBPQ96SI9 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
STRBPQ96SI9 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
STRBPQ96SI9 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
STRBPQ96SI9 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
STRBPQ96SI9 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
STRBPQ96SI9 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
STRBPQ96SI9 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
STRBPQ96SI9 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
STRBPQ96SI9 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
STRBPQ96SI9 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
STRBPQ96SI9 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
STRBPQ96SI9 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
STRBPQ96SI9 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
STRBPQ96SI9 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
STRBPQ96SI9 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
STRBPQ96SI9 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
STRBPQ96SI9 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
STRBPQ96SI9 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
STRBPQ96SI9 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
STRBPQ96SI9 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
STRBPQ96SI9 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
STRBPQ96SI9 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
STRBPQ96SI9 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
STRBPQ96SI9 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
STRBPQ96SI9 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
STRBPQ96SI9 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
STRBPQ96SI9 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
STRBPQ96SI9 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
STRBPQ96SI9 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
STRBPQ96SI9 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
STRBPQ96SI9 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
STRBPQ96SI9 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
STRBPQ96SI9 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
STRBPQ96SI9 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
STRBPQ96SI9 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
STRBPQ96SI9 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
STRBPQ96SI9 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
STRBPQ96SI9 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
STRBPQ96SI9 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
STRBPQ96SI9 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
STRBPQ96SI9 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
STRBPQ96SI9 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
STRBPQ96SI9 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
STRBPQ96SI9 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
STRBPQ96SI9 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
STRBPQ96SI9 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
STRBPQ96SI9 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
STRBPQ96SI9 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
STRBPQ96SI9 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
STRBPQ96SI9 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
STRBPQ96SI9 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
STRBPQ96SI9 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
STRBPQ96SI9 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
STRBPQ96SI9 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
STRBPQ96SI9 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
STRBPQ96SI9 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
STRBPQ96SI9 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
STRBPQ96SI9 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
STRBPQ96SI9 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
STRBPQ96SI9 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
STRBPQ96SI9 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
STRBPQ96SI9 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
STRBPQ96SI9 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
STRBPQ96SI9 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.09
STRBPQ96SI9 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
STRBPQ96SI9 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
STRBPQ96SI9 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
STRBPQ96SI9 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.8 ms