Protein–RNA interactions for Protein: Q96RK0

CIC, Protein capicua homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,608 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CICQ96RK0 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
CICQ96RK0 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
CICQ96RK0 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
CICQ96RK0 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
CICQ96RK0 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
CICQ96RK0 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
CICQ96RK0 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
CICQ96RK0 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
CICQ96RK0 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC30.43■■■□□ 2.46
CICQ96RK0 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
CICQ96RK0 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC30.43■■■□□ 2.46
CICQ96RK0 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC30.42■■■□□ 2.46
CICQ96RK0 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
CICQ96RK0 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
CICQ96RK0 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
CICQ96RK0 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
CICQ96RK0 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
CICQ96RK0 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC30.4■■■□□ 2.46
CICQ96RK0 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
CICQ96RK0 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
CICQ96RK0 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
CICQ96RK0 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
CICQ96RK0 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
CICQ96RK0 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
CICQ96RK0 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
CICQ96RK0 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
CICQ96RK0 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
CICQ96RK0 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
CICQ96RK0 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
CICQ96RK0 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
CICQ96RK0 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
CICQ96RK0 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
CICQ96RK0 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
CICQ96RK0 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC30.37■■■□□ 2.45
CICQ96RK0 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
CICQ96RK0 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
CICQ96RK0 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
CICQ96RK0 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
CICQ96RK0 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
CICQ96RK0 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
CICQ96RK0 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
CICQ96RK0 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
CICQ96RK0 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
CICQ96RK0 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC30.36■■■□□ 2.45
CICQ96RK0 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
CICQ96RK0 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
CICQ96RK0 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
CICQ96RK0 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
CICQ96RK0 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
CICQ96RK0 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
CICQ96RK0 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
CICQ96RK0 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
CICQ96RK0 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
CICQ96RK0 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
CICQ96RK0 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
CICQ96RK0 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
CICQ96RK0 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
CICQ96RK0 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
CICQ96RK0 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
CICQ96RK0 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
CICQ96RK0 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
CICQ96RK0 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC30.33■■■□□ 2.45
CICQ96RK0 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC30.33■■■□□ 2.45
CICQ96RK0 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC30.33■■■□□ 2.45
CICQ96RK0 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
CICQ96RK0 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
CICQ96RK0 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC30.33■■■□□ 2.45
CICQ96RK0 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
CICQ96RK0 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
CICQ96RK0 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC30.32■■■□□ 2.44
CICQ96RK0 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
CICQ96RK0 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
CICQ96RK0 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
CICQ96RK0 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
CICQ96RK0 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
CICQ96RK0 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
CICQ96RK0 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC30.31■■■□□ 2.44
CICQ96RK0 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
CICQ96RK0 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
CICQ96RK0 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
CICQ96RK0 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
CICQ96RK0 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
CICQ96RK0 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
CICQ96RK0 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
CICQ96RK0 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
CICQ96RK0 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
CICQ96RK0 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
CICQ96RK0 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
CICQ96RK0 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
CICQ96RK0 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC30.29■■■□□ 2.44
CICQ96RK0 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
CICQ96RK0 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
CICQ96RK0 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
CICQ96RK0 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC30.28■■■□□ 2.44
CICQ96RK0 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
CICQ96RK0 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC30.28■■■□□ 2.44
CICQ96RK0 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
CICQ96RK0 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
CICQ96RK0 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
CICQ96RK0 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 133 ms