Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q40

CDK15, Cyclin-dependent kinase 15, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK15Q96Q40 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDK15Q96Q40 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDK15Q96Q40 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDK15Q96Q40 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDK15Q96Q40 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDK15Q96Q40 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDK15Q96Q40 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDK15Q96Q40 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDK15Q96Q40 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDK15Q96Q40 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDK15Q96Q40 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
CDK15Q96Q40 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDK15Q96Q40 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDK15Q96Q40 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDK15Q96Q40 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDK15Q96Q40 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDK15Q96Q40 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDK15Q96Q40 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDK15Q96Q40 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDK15Q96Q40 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDK15Q96Q40 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDK15Q96Q40 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDK15Q96Q40 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDK15Q96Q40 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDK15Q96Q40 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDK15Q96Q40 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDK15Q96Q40 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDK15Q96Q40 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CDK15Q96Q40 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDK15Q96Q40 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDK15Q96Q40 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDK15Q96Q40 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDK15Q96Q40 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDK15Q96Q40 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDK15Q96Q40 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDK15Q96Q40 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDK15Q96Q40 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDK15Q96Q40 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDK15Q96Q40 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDK15Q96Q40 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDK15Q96Q40 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDK15Q96Q40 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDK15Q96Q40 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDK15Q96Q40 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDK15Q96Q40 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDK15Q96Q40 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDK15Q96Q40 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDK15Q96Q40 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDK15Q96Q40 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDK15Q96Q40 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDK15Q96Q40 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDK15Q96Q40 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDK15Q96Q40 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDK15Q96Q40 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDK15Q96Q40 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDK15Q96Q40 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDK15Q96Q40 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDK15Q96Q40 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDK15Q96Q40 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDK15Q96Q40 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDK15Q96Q40 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDK15Q96Q40 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDK15Q96Q40 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDK15Q96Q40 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CDK15Q96Q40 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDK15Q96Q40 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDK15Q96Q40 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDK15Q96Q40 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CDK15Q96Q40 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDK15Q96Q40 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDK15Q96Q40 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDK15Q96Q40 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDK15Q96Q40 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDK15Q96Q40 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDK15Q96Q40 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDK15Q96Q40 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDK15Q96Q40 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDK15Q96Q40 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDK15Q96Q40 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDK15Q96Q40 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDK15Q96Q40 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDK15Q96Q40 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDK15Q96Q40 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDK15Q96Q40 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDK15Q96Q40 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDK15Q96Q40 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CDK15Q96Q40 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDK15Q96Q40 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDK15Q96Q40 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDK15Q96Q40 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDK15Q96Q40 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDK15Q96Q40 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDK15Q96Q40 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDK15Q96Q40 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CDK15Q96Q40 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDK15Q96Q40 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDK15Q96Q40 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDK15Q96Q40 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDK15Q96Q40 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDK15Q96Q40 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 688.3 ms