Protein–RNA interactions for Protein: Q96P64

AGAP4, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP4Q96P64 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
AGAP4Q96P64 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
AGAP4Q96P64 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
AGAP4Q96P64 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
AGAP4Q96P64 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
AGAP4Q96P64 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
AGAP4Q96P64 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
AGAP4Q96P64 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
AGAP4Q96P64 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
AGAP4Q96P64 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
AGAP4Q96P64 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
AGAP4Q96P64 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
AGAP4Q96P64 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
AGAP4Q96P64 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
AGAP4Q96P64 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
AGAP4Q96P64 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
AGAP4Q96P64 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
AGAP4Q96P64 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
AGAP4Q96P64 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
AGAP4Q96P64 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
AGAP4Q96P64 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
AGAP4Q96P64 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
AGAP4Q96P64 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
AGAP4Q96P64 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
AGAP4Q96P64 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
AGAP4Q96P64 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
AGAP4Q96P64 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
AGAP4Q96P64 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
AGAP4Q96P64 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
AGAP4Q96P64 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
AGAP4Q96P64 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
AGAP4Q96P64 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AGAP4Q96P64 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
AGAP4Q96P64 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
AGAP4Q96P64 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AGAP4Q96P64 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
AGAP4Q96P64 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
AGAP4Q96P64 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AGAP4Q96P64 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AGAP4Q96P64 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AGAP4Q96P64 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AGAP4Q96P64 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AGAP4Q96P64 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
AGAP4Q96P64 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
AGAP4Q96P64 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AGAP4Q96P64 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AGAP4Q96P64 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AGAP4Q96P64 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AGAP4Q96P64 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
AGAP4Q96P64 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
AGAP4Q96P64 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
AGAP4Q96P64 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
AGAP4Q96P64 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
AGAP4Q96P64 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
AGAP4Q96P64 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
AGAP4Q96P64 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
AGAP4Q96P64 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
AGAP4Q96P64 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
AGAP4Q96P64 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
AGAP4Q96P64 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
AGAP4Q96P64 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
AGAP4Q96P64 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
AGAP4Q96P64 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
AGAP4Q96P64 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
AGAP4Q96P64 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
AGAP4Q96P64 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
AGAP4Q96P64 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
AGAP4Q96P64 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
AGAP4Q96P64 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AGAP4Q96P64 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AGAP4Q96P64 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AGAP4Q96P64 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AGAP4Q96P64 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
AGAP4Q96P64 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
AGAP4Q96P64 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
AGAP4Q96P64 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AGAP4Q96P64 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AGAP4Q96P64 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
AGAP4Q96P64 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AGAP4Q96P64 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AGAP4Q96P64 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
AGAP4Q96P64 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
AGAP4Q96P64 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AGAP4Q96P64 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
AGAP4Q96P64 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AGAP4Q96P64 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
AGAP4Q96P64 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
AGAP4Q96P64 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
AGAP4Q96P64 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AGAP4Q96P64 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AGAP4Q96P64 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AGAP4Q96P64 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
AGAP4Q96P64 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AGAP4Q96P64 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AGAP4Q96P64 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
AGAP4Q96P64 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
AGAP4Q96P64 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
AGAP4Q96P64 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
AGAP4Q96P64 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
AGAP4Q96P64 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms