Protein–RNA interactions for Protein: Q96NR8

RDH12, Retinol dehydrogenase 12, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDH12Q96NR8 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RDH12Q96NR8 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RDH12Q96NR8 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RDH12Q96NR8 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RDH12Q96NR8 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RDH12Q96NR8 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RDH12Q96NR8 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RDH12Q96NR8 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RDH12Q96NR8 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RDH12Q96NR8 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RDH12Q96NR8 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RDH12Q96NR8 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RDH12Q96NR8 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RDH12Q96NR8 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RDH12Q96NR8 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RDH12Q96NR8 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RDH12Q96NR8 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RDH12Q96NR8 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RDH12Q96NR8 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RDH12Q96NR8 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RDH12Q96NR8 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RDH12Q96NR8 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RDH12Q96NR8 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RDH12Q96NR8 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RDH12Q96NR8 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RDH12Q96NR8 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RDH12Q96NR8 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RDH12Q96NR8 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RDH12Q96NR8 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RDH12Q96NR8 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RDH12Q96NR8 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
RDH12Q96NR8 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RDH12Q96NR8 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RDH12Q96NR8 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RDH12Q96NR8 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RDH12Q96NR8 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RDH12Q96NR8 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RDH12Q96NR8 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RDH12Q96NR8 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RDH12Q96NR8 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RDH12Q96NR8 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RDH12Q96NR8 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RDH12Q96NR8 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RDH12Q96NR8 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RDH12Q96NR8 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RDH12Q96NR8 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RDH12Q96NR8 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RDH12Q96NR8 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RDH12Q96NR8 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RDH12Q96NR8 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RDH12Q96NR8 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RDH12Q96NR8 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RDH12Q96NR8 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
RDH12Q96NR8 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RDH12Q96NR8 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RDH12Q96NR8 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RDH12Q96NR8 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RDH12Q96NR8 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RDH12Q96NR8 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RDH12Q96NR8 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RDH12Q96NR8 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RDH12Q96NR8 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RDH12Q96NR8 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RDH12Q96NR8 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RDH12Q96NR8 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
RDH12Q96NR8 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RDH12Q96NR8 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RDH12Q96NR8 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RDH12Q96NR8 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RDH12Q96NR8 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RDH12Q96NR8 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
RDH12Q96NR8 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
RDH12Q96NR8 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RDH12Q96NR8 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RDH12Q96NR8 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RDH12Q96NR8 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
RDH12Q96NR8 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RDH12Q96NR8 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RDH12Q96NR8 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RDH12Q96NR8 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RDH12Q96NR8 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RDH12Q96NR8 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RDH12Q96NR8 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RDH12Q96NR8 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RDH12Q96NR8 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RDH12Q96NR8 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RDH12Q96NR8 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RDH12Q96NR8 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RDH12Q96NR8 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RDH12Q96NR8 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
RDH12Q96NR8 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
RDH12Q96NR8 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
RDH12Q96NR8 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RDH12Q96NR8 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RDH12Q96NR8 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RDH12Q96NR8 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RDH12Q96NR8 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RDH12Q96NR8 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RDH12Q96NR8 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RDH12Q96NR8 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms