Protein–RNA interactions for Protein: Q96NB2

SFXN2, Sideroflexin-2, humanhuman

Predictions only

Length 322 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFXN2Q96NB2 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SFXN2Q96NB2 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SFXN2Q96NB2 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SFXN2Q96NB2 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SFXN2Q96NB2 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SFXN2Q96NB2 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SFXN2Q96NB2 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SFXN2Q96NB2 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SFXN2Q96NB2 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SFXN2Q96NB2 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SFXN2Q96NB2 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SFXN2Q96NB2 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SFXN2Q96NB2 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SFXN2Q96NB2 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SFXN2Q96NB2 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SFXN2Q96NB2 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SFXN2Q96NB2 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SFXN2Q96NB2 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SFXN2Q96NB2 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SFXN2Q96NB2 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SFXN2Q96NB2 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SFXN2Q96NB2 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SFXN2Q96NB2 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SFXN2Q96NB2 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SFXN2Q96NB2 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SFXN2Q96NB2 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SFXN2Q96NB2 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SFXN2Q96NB2 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SFXN2Q96NB2 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SFXN2Q96NB2 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SFXN2Q96NB2 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SFXN2Q96NB2 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SFXN2Q96NB2 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SFXN2Q96NB2 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SFXN2Q96NB2 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SFXN2Q96NB2 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SFXN2Q96NB2 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SFXN2Q96NB2 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SFXN2Q96NB2 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SFXN2Q96NB2 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SFXN2Q96NB2 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SFXN2Q96NB2 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SFXN2Q96NB2 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SFXN2Q96NB2 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SFXN2Q96NB2 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SFXN2Q96NB2 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SFXN2Q96NB2 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SFXN2Q96NB2 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SFXN2Q96NB2 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SFXN2Q96NB2 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SFXN2Q96NB2 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SFXN2Q96NB2 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SFXN2Q96NB2 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SFXN2Q96NB2 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SFXN2Q96NB2 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SFXN2Q96NB2 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SFXN2Q96NB2 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SFXN2Q96NB2 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SFXN2Q96NB2 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SFXN2Q96NB2 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SFXN2Q96NB2 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SFXN2Q96NB2 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SFXN2Q96NB2 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SFXN2Q96NB2 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SFXN2Q96NB2 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SFXN2Q96NB2 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SFXN2Q96NB2 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SFXN2Q96NB2 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SFXN2Q96NB2 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SFXN2Q96NB2 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SFXN2Q96NB2 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SFXN2Q96NB2 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SFXN2Q96NB2 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SFXN2Q96NB2 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SFXN2Q96NB2 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SFXN2Q96NB2 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SFXN2Q96NB2 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SFXN2Q96NB2 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SFXN2Q96NB2 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SFXN2Q96NB2 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SFXN2Q96NB2 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SFXN2Q96NB2 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SFXN2Q96NB2 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SFXN2Q96NB2 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SFXN2Q96NB2 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SFXN2Q96NB2 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SFXN2Q96NB2 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SFXN2Q96NB2 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SFXN2Q96NB2 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SFXN2Q96NB2 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SFXN2Q96NB2 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SFXN2Q96NB2 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SFXN2Q96NB2 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SFXN2Q96NB2 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SFXN2Q96NB2 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SFXN2Q96NB2 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SFXN2Q96NB2 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SFXN2Q96NB2 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SFXN2Q96NB2 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SFXN2Q96NB2 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms