Protein–RNA interactions for Protein: Q96MG8

PCMTD1, Protein-L-isoaspartate O-methyltransferase domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCMTD1Q96MG8 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PCMTD1Q96MG8 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PCMTD1Q96MG8 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PCMTD1Q96MG8 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PCMTD1Q96MG8 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PCMTD1Q96MG8 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PCMTD1Q96MG8 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PCMTD1Q96MG8 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PCMTD1Q96MG8 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PCMTD1Q96MG8 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PCMTD1Q96MG8 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PCMTD1Q96MG8 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PCMTD1Q96MG8 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
PCMTD1Q96MG8 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PCMTD1Q96MG8 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PCMTD1Q96MG8 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PCMTD1Q96MG8 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PCMTD1Q96MG8 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PCMTD1Q96MG8 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PCMTD1Q96MG8 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
PCMTD1Q96MG8 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PCMTD1Q96MG8 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PCMTD1Q96MG8 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PCMTD1Q96MG8 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PCMTD1Q96MG8 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PCMTD1Q96MG8 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PCMTD1Q96MG8 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PCMTD1Q96MG8 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PCMTD1Q96MG8 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
PCMTD1Q96MG8 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PCMTD1Q96MG8 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PCMTD1Q96MG8 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PCMTD1Q96MG8 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PCMTD1Q96MG8 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
PCMTD1Q96MG8 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PCMTD1Q96MG8 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PCMTD1Q96MG8 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PCMTD1Q96MG8 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PCMTD1Q96MG8 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PCMTD1Q96MG8 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PCMTD1Q96MG8 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PCMTD1Q96MG8 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PCMTD1Q96MG8 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PCMTD1Q96MG8 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PCMTD1Q96MG8 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PCMTD1Q96MG8 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PCMTD1Q96MG8 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PCMTD1Q96MG8 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PCMTD1Q96MG8 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PCMTD1Q96MG8 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PCMTD1Q96MG8 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PCMTD1Q96MG8 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PCMTD1Q96MG8 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PCMTD1Q96MG8 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PCMTD1Q96MG8 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PCMTD1Q96MG8 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PCMTD1Q96MG8 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PCMTD1Q96MG8 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PCMTD1Q96MG8 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PCMTD1Q96MG8 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PCMTD1Q96MG8 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PCMTD1Q96MG8 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PCMTD1Q96MG8 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PCMTD1Q96MG8 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PCMTD1Q96MG8 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PCMTD1Q96MG8 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PCMTD1Q96MG8 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PCMTD1Q96MG8 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PCMTD1Q96MG8 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PCMTD1Q96MG8 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PCMTD1Q96MG8 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PCMTD1Q96MG8 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PCMTD1Q96MG8 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PCMTD1Q96MG8 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PCMTD1Q96MG8 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PCMTD1Q96MG8 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PCMTD1Q96MG8 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PCMTD1Q96MG8 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PCMTD1Q96MG8 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
PCMTD1Q96MG8 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PCMTD1Q96MG8 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PCMTD1Q96MG8 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PCMTD1Q96MG8 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PCMTD1Q96MG8 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PCMTD1Q96MG8 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PCMTD1Q96MG8 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PCMTD1Q96MG8 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PCMTD1Q96MG8 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PCMTD1Q96MG8 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PCMTD1Q96MG8 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PCMTD1Q96MG8 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PCMTD1Q96MG8 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PCMTD1Q96MG8 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PCMTD1Q96MG8 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PCMTD1Q96MG8 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PCMTD1Q96MG8 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PCMTD1Q96MG8 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PCMTD1Q96MG8 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PCMTD1Q96MG8 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PCMTD1Q96MG8 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms