Protein–RNA interactions for Protein: Q96KN9

GJD4, Gap junction delta-4 protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJD4Q96KN9 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC31.76■■■□□ 2.67
GJD4Q96KN9 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
GJD4Q96KN9 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
GJD4Q96KN9 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
GJD4Q96KN9 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.75■■■□□ 2.67
GJD4Q96KN9 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.74■■■□□ 2.67
GJD4Q96KN9 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC31.74■■■□□ 2.67
GJD4Q96KN9 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
GJD4Q96KN9 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC31.73■■■□□ 2.67
GJD4Q96KN9 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC31.73■■■□□ 2.67
GJD4Q96KN9 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC31.72■■■□□ 2.67
GJD4Q96KN9 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
GJD4Q96KN9 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
GJD4Q96KN9 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC31.72■■■□□ 2.67
GJD4Q96KN9 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
GJD4Q96KN9 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC31.71■■■□□ 2.67
GJD4Q96KN9 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.71■■■□□ 2.67
GJD4Q96KN9 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
GJD4Q96KN9 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
GJD4Q96KN9 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC31.7■■■□□ 2.67
GJD4Q96KN9 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
GJD4Q96KN9 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC31.7■■■□□ 2.67
GJD4Q96KN9 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
GJD4Q96KN9 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
GJD4Q96KN9 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC31.69■■■□□ 2.66
GJD4Q96KN9 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
GJD4Q96KN9 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC31.69■■■□□ 2.66
GJD4Q96KN9 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.69■■■□□ 2.66
GJD4Q96KN9 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
GJD4Q96KN9 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
GJD4Q96KN9 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC31.68■■■□□ 2.66
GJD4Q96KN9 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC31.68■■■□□ 2.66
GJD4Q96KN9 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.68■■■□□ 2.66
GJD4Q96KN9 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.67■■■□□ 2.66
GJD4Q96KN9 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
GJD4Q96KN9 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC31.67■■■□□ 2.66
GJD4Q96KN9 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC31.67■■■□□ 2.66
GJD4Q96KN9 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.67■■■□□ 2.66
GJD4Q96KN9 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
GJD4Q96KN9 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
GJD4Q96KN9 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC31.66■■■□□ 2.66
GJD4Q96KN9 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC31.65■■■□□ 2.66
GJD4Q96KN9 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC31.65■■■□□ 2.66
GJD4Q96KN9 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC31.65■■■□□ 2.66
GJD4Q96KN9 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.65■■■□□ 2.66
GJD4Q96KN9 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC31.64■■■□□ 2.66
GJD4Q96KN9 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC31.64■■■□□ 2.66
GJD4Q96KN9 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
GJD4Q96KN9 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC31.64■■■□□ 2.66
GJD4Q96KN9 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC31.63■■■□□ 2.65
GJD4Q96KN9 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC31.63■■■□□ 2.65
GJD4Q96KN9 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC31.63■■■□□ 2.65
GJD4Q96KN9 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.63■■■□□ 2.65
GJD4Q96KN9 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC31.63■■■□□ 2.65
GJD4Q96KN9 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
GJD4Q96KN9 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC31.62■■■□□ 2.65
GJD4Q96KN9 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.62■■■□□ 2.65
GJD4Q96KN9 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC31.62■■■□□ 2.65
GJD4Q96KN9 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC31.62■■■□□ 2.65
GJD4Q96KN9 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
GJD4Q96KN9 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC31.61■■■□□ 2.65
GJD4Q96KN9 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC31.61■■■□□ 2.65
GJD4Q96KN9 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC31.61■■■□□ 2.65
GJD4Q96KN9 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC31.61■■■□□ 2.65
GJD4Q96KN9 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
GJD4Q96KN9 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
GJD4Q96KN9 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC31.59■■■□□ 2.65
GJD4Q96KN9 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC31.59■■■□□ 2.65
GJD4Q96KN9 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC31.59■■■□□ 2.65
GJD4Q96KN9 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC31.59■■■□□ 2.65
GJD4Q96KN9 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
GJD4Q96KN9 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC31.57■■■□□ 2.64
GJD4Q96KN9 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC31.57■■■□□ 2.64
GJD4Q96KN9 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
GJD4Q96KN9 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.64
GJD4Q96KN9 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC31.56■■■□□ 2.64
GJD4Q96KN9 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC31.56■■■□□ 2.64
GJD4Q96KN9 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
GJD4Q96KN9 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC31.55■■■□□ 2.64
GJD4Q96KN9 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.55■■■□□ 2.64
GJD4Q96KN9 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
GJD4Q96KN9 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC31.54■■■□□ 2.64
GJD4Q96KN9 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC31.54■■■□□ 2.64
GJD4Q96KN9 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC31.54■■■□□ 2.64
GJD4Q96KN9 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC31.53■■■□□ 2.64
GJD4Q96KN9 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC31.53■■■□□ 2.64
GJD4Q96KN9 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
GJD4Q96KN9 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
GJD4Q96KN9 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.52■■■□□ 2.64
GJD4Q96KN9 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
GJD4Q96KN9 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC31.52■■■□□ 2.64
GJD4Q96KN9 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC31.52■■■□□ 2.64
GJD4Q96KN9 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
GJD4Q96KN9 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
GJD4Q96KN9 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
GJD4Q96KN9 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
GJD4Q96KN9 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
GJD4Q96KN9 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
GJD4Q96KN9 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC31.5■■■□□ 2.63
GJD4Q96KN9 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111.6 ms