Protein–RNA interactions for Protein: Q96JJ7

TMX3, Protein disulfide-isomerase TMX3, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMX3Q96JJ7 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TMX3Q96JJ7 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TMX3Q96JJ7 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
TMX3Q96JJ7 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
TMX3Q96JJ7 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TMX3Q96JJ7 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TMX3Q96JJ7 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TMX3Q96JJ7 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TMX3Q96JJ7 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TMX3Q96JJ7 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TMX3Q96JJ7 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TMX3Q96JJ7 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TMX3Q96JJ7 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TMX3Q96JJ7 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TMX3Q96JJ7 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TMX3Q96JJ7 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TMX3Q96JJ7 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TMX3Q96JJ7 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TMX3Q96JJ7 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TMX3Q96JJ7 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TMX3Q96JJ7 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TMX3Q96JJ7 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TMX3Q96JJ7 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TMX3Q96JJ7 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TMX3Q96JJ7 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TMX3Q96JJ7 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TMX3Q96JJ7 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TMX3Q96JJ7 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
TMX3Q96JJ7 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TMX3Q96JJ7 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TMX3Q96JJ7 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TMX3Q96JJ7 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TMX3Q96JJ7 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TMX3Q96JJ7 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
TMX3Q96JJ7 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
TMX3Q96JJ7 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TMX3Q96JJ7 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TMX3Q96JJ7 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TMX3Q96JJ7 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TMX3Q96JJ7 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TMX3Q96JJ7 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TMX3Q96JJ7 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TMX3Q96JJ7 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
TMX3Q96JJ7 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TMX3Q96JJ7 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TMX3Q96JJ7 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TMX3Q96JJ7 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TMX3Q96JJ7 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TMX3Q96JJ7 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TMX3Q96JJ7 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TMX3Q96JJ7 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TMX3Q96JJ7 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
TMX3Q96JJ7 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TMX3Q96JJ7 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TMX3Q96JJ7 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TMX3Q96JJ7 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TMX3Q96JJ7 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TMX3Q96JJ7 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TMX3Q96JJ7 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TMX3Q96JJ7 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TMX3Q96JJ7 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TMX3Q96JJ7 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TMX3Q96JJ7 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
TMX3Q96JJ7 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TMX3Q96JJ7 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
TMX3Q96JJ7 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
TMX3Q96JJ7 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TMX3Q96JJ7 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
TMX3Q96JJ7 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TMX3Q96JJ7 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TMX3Q96JJ7 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TMX3Q96JJ7 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TMX3Q96JJ7 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TMX3Q96JJ7 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TMX3Q96JJ7 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TMX3Q96JJ7 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TMX3Q96JJ7 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TMX3Q96JJ7 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TMX3Q96JJ7 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TMX3Q96JJ7 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TMX3Q96JJ7 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TMX3Q96JJ7 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TMX3Q96JJ7 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TMX3Q96JJ7 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TMX3Q96JJ7 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TMX3Q96JJ7 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
TMX3Q96JJ7 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC27.76■■■□□ 2.03
TMX3Q96JJ7 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
TMX3Q96JJ7 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
TMX3Q96JJ7 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TMX3Q96JJ7 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TMX3Q96JJ7 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TMX3Q96JJ7 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
TMX3Q96JJ7 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TMX3Q96JJ7 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TMX3Q96JJ7 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TMX3Q96JJ7 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TMX3Q96JJ7 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TMX3Q96JJ7 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TMX3Q96JJ7 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.6 ms