Protein–RNA interactions for Protein: Q96JH7

VCPIP1, Deubiquitinating protein VCIP135, humanhuman

Predictions only

Length 1,222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VCPIP1Q96JH7 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
VCPIP1Q96JH7 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
VCPIP1Q96JH7 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
VCPIP1Q96JH7 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
VCPIP1Q96JH7 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
VCPIP1Q96JH7 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
VCPIP1Q96JH7 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
VCPIP1Q96JH7 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
VCPIP1Q96JH7 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
VCPIP1Q96JH7 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
VCPIP1Q96JH7 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
VCPIP1Q96JH7 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
VCPIP1Q96JH7 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
VCPIP1Q96JH7 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
VCPIP1Q96JH7 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
VCPIP1Q96JH7 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
VCPIP1Q96JH7 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
VCPIP1Q96JH7 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
VCPIP1Q96JH7 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
VCPIP1Q96JH7 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
VCPIP1Q96JH7 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
VCPIP1Q96JH7 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
VCPIP1Q96JH7 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
VCPIP1Q96JH7 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
VCPIP1Q96JH7 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
VCPIP1Q96JH7 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
VCPIP1Q96JH7 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
VCPIP1Q96JH7 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
VCPIP1Q96JH7 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
VCPIP1Q96JH7 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
VCPIP1Q96JH7 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
VCPIP1Q96JH7 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
VCPIP1Q96JH7 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
VCPIP1Q96JH7 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
VCPIP1Q96JH7 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
VCPIP1Q96JH7 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
VCPIP1Q96JH7 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
VCPIP1Q96JH7 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
VCPIP1Q96JH7 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
VCPIP1Q96JH7 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
VCPIP1Q96JH7 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
VCPIP1Q96JH7 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
VCPIP1Q96JH7 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
VCPIP1Q96JH7 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
VCPIP1Q96JH7 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
VCPIP1Q96JH7 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
VCPIP1Q96JH7 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
VCPIP1Q96JH7 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
VCPIP1Q96JH7 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
VCPIP1Q96JH7 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
VCPIP1Q96JH7 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
VCPIP1Q96JH7 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
VCPIP1Q96JH7 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
VCPIP1Q96JH7 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
VCPIP1Q96JH7 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
VCPIP1Q96JH7 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
VCPIP1Q96JH7 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
VCPIP1Q96JH7 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
VCPIP1Q96JH7 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
VCPIP1Q96JH7 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
VCPIP1Q96JH7 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
VCPIP1Q96JH7 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
VCPIP1Q96JH7 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
VCPIP1Q96JH7 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
VCPIP1Q96JH7 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
VCPIP1Q96JH7 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
VCPIP1Q96JH7 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
VCPIP1Q96JH7 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
VCPIP1Q96JH7 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
VCPIP1Q96JH7 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
VCPIP1Q96JH7 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
VCPIP1Q96JH7 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
VCPIP1Q96JH7 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
VCPIP1Q96JH7 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
VCPIP1Q96JH7 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
VCPIP1Q96JH7 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
VCPIP1Q96JH7 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
VCPIP1Q96JH7 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
VCPIP1Q96JH7 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
VCPIP1Q96JH7 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
VCPIP1Q96JH7 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
VCPIP1Q96JH7 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
VCPIP1Q96JH7 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
VCPIP1Q96JH7 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
VCPIP1Q96JH7 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
VCPIP1Q96JH7 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
VCPIP1Q96JH7 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
VCPIP1Q96JH7 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
VCPIP1Q96JH7 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
VCPIP1Q96JH7 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
VCPIP1Q96JH7 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
VCPIP1Q96JH7 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
VCPIP1Q96JH7 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
VCPIP1Q96JH7 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
VCPIP1Q96JH7 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
VCPIP1Q96JH7 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
VCPIP1Q96JH7 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
VCPIP1Q96JH7 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
VCPIP1Q96JH7 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
VCPIP1Q96JH7 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms