Protein–RNA interactions for Protein: Q96JA1

LRIG1, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG1Q96JA1 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
LRIG1Q96JA1 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
LRIG1Q96JA1 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LRIG1Q96JA1 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LRIG1Q96JA1 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LRIG1Q96JA1 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
LRIG1Q96JA1 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
LRIG1Q96JA1 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LRIG1Q96JA1 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
LRIG1Q96JA1 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LRIG1Q96JA1 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
LRIG1Q96JA1 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LRIG1Q96JA1 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LRIG1Q96JA1 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
LRIG1Q96JA1 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
LRIG1Q96JA1 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LRIG1Q96JA1 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
LRIG1Q96JA1 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LRIG1Q96JA1 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
LRIG1Q96JA1 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
LRIG1Q96JA1 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LRIG1Q96JA1 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LRIG1Q96JA1 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LRIG1Q96JA1 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LRIG1Q96JA1 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LRIG1Q96JA1 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LRIG1Q96JA1 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LRIG1Q96JA1 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LRIG1Q96JA1 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LRIG1Q96JA1 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LRIG1Q96JA1 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LRIG1Q96JA1 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LRIG1Q96JA1 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LRIG1Q96JA1 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LRIG1Q96JA1 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LRIG1Q96JA1 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LRIG1Q96JA1 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LRIG1Q96JA1 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LRIG1Q96JA1 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LRIG1Q96JA1 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LRIG1Q96JA1 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LRIG1Q96JA1 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LRIG1Q96JA1 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LRIG1Q96JA1 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LRIG1Q96JA1 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LRIG1Q96JA1 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LRIG1Q96JA1 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LRIG1Q96JA1 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LRIG1Q96JA1 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.77■■□□□ 1.4
LRIG1Q96JA1 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LRIG1Q96JA1 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LRIG1Q96JA1 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
LRIG1Q96JA1 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LRIG1Q96JA1 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LRIG1Q96JA1 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LRIG1Q96JA1 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LRIG1Q96JA1 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LRIG1Q96JA1 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LRIG1Q96JA1 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
LRIG1Q96JA1 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LRIG1Q96JA1 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LRIG1Q96JA1 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LRIG1Q96JA1 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LRIG1Q96JA1 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LRIG1Q96JA1 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LRIG1Q96JA1 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LRIG1Q96JA1 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LRIG1Q96JA1 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LRIG1Q96JA1 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LRIG1Q96JA1 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LRIG1Q96JA1 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LRIG1Q96JA1 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LRIG1Q96JA1 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LRIG1Q96JA1 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LRIG1Q96JA1 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LRIG1Q96JA1 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LRIG1Q96JA1 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LRIG1Q96JA1 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LRIG1Q96JA1 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
LRIG1Q96JA1 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
LRIG1Q96JA1 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LRIG1Q96JA1 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LRIG1Q96JA1 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
LRIG1Q96JA1 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LRIG1Q96JA1 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LRIG1Q96JA1 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LRIG1Q96JA1 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LRIG1Q96JA1 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LRIG1Q96JA1 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LRIG1Q96JA1 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LRIG1Q96JA1 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LRIG1Q96JA1 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LRIG1Q96JA1 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LRIG1Q96JA1 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LRIG1Q96JA1 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LRIG1Q96JA1 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LRIG1Q96JA1 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LRIG1Q96JA1 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LRIG1Q96JA1 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LRIG1Q96JA1 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms