Protein–RNA interactions for Protein: Q96IS3

RAX2, Retina and anterior neural fold homeobox protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAX2Q96IS3 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAX2Q96IS3 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAX2Q96IS3 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAX2Q96IS3 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAX2Q96IS3 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
RAX2Q96IS3 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAX2Q96IS3 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAX2Q96IS3 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAX2Q96IS3 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAX2Q96IS3 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
RAX2Q96IS3 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
RAX2Q96IS3 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAX2Q96IS3 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAX2Q96IS3 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAX2Q96IS3 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAX2Q96IS3 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAX2Q96IS3 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RAX2Q96IS3 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RAX2Q96IS3 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RAX2Q96IS3 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RAX2Q96IS3 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RAX2Q96IS3 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
RAX2Q96IS3 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RAX2Q96IS3 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RAX2Q96IS3 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RAX2Q96IS3 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RAX2Q96IS3 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAX2Q96IS3 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAX2Q96IS3 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAX2Q96IS3 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAX2Q96IS3 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAX2Q96IS3 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAX2Q96IS3 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAX2Q96IS3 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAX2Q96IS3 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAX2Q96IS3 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAX2Q96IS3 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAX2Q96IS3 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAX2Q96IS3 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAX2Q96IS3 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAX2Q96IS3 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAX2Q96IS3 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAX2Q96IS3 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAX2Q96IS3 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAX2Q96IS3 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAX2Q96IS3 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAX2Q96IS3 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAX2Q96IS3 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAX2Q96IS3 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAX2Q96IS3 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAX2Q96IS3 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAX2Q96IS3 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAX2Q96IS3 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
RAX2Q96IS3 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAX2Q96IS3 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAX2Q96IS3 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAX2Q96IS3 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAX2Q96IS3 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
RAX2Q96IS3 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAX2Q96IS3 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAX2Q96IS3 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAX2Q96IS3 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAX2Q96IS3 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAX2Q96IS3 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAX2Q96IS3 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAX2Q96IS3 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAX2Q96IS3 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
RAX2Q96IS3 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAX2Q96IS3 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAX2Q96IS3 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAX2Q96IS3 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAX2Q96IS3 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAX2Q96IS3 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAX2Q96IS3 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAX2Q96IS3 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAX2Q96IS3 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAX2Q96IS3 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAX2Q96IS3 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAX2Q96IS3 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAX2Q96IS3 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAX2Q96IS3 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAX2Q96IS3 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAX2Q96IS3 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAX2Q96IS3 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAX2Q96IS3 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAX2Q96IS3 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAX2Q96IS3 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAX2Q96IS3 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAX2Q96IS3 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAX2Q96IS3 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAX2Q96IS3 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAX2Q96IS3 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAX2Q96IS3 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
RAX2Q96IS3 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAX2Q96IS3 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAX2Q96IS3 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
RAX2Q96IS3 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RAX2Q96IS3 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RAX2Q96IS3 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RAX2Q96IS3 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms