Protein–RNA interactions for Protein: Q96HJ5

MS4A3, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A3Q96HJ5 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
MS4A3Q96HJ5 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
MS4A3Q96HJ5 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
MS4A3Q96HJ5 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
MS4A3Q96HJ5 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
MS4A3Q96HJ5 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
MS4A3Q96HJ5 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
MS4A3Q96HJ5 MTND4LP12-201ENST00000448237 295 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
MS4A3Q96HJ5 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
MS4A3Q96HJ5 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
MS4A3Q96HJ5 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
MS4A3Q96HJ5 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
MS4A3Q96HJ5 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
MS4A3Q96HJ5 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
MS4A3Q96HJ5 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
MS4A3Q96HJ5 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
MS4A3Q96HJ5 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
MS4A3Q96HJ5 LINC01551-203ENST00000550266 455 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
MS4A3Q96HJ5 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
MS4A3Q96HJ5 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
MS4A3Q96HJ5 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
MS4A3Q96HJ5 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
MS4A3Q96HJ5 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
MS4A3Q96HJ5 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
MS4A3Q96HJ5 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
MS4A3Q96HJ5 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
MS4A3Q96HJ5 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
MS4A3Q96HJ5 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
MS4A3Q96HJ5 AC073575.1-201ENST00000551125 596 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
MS4A3Q96HJ5 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
MS4A3Q96HJ5 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
MS4A3Q96HJ5 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
MS4A3Q96HJ5 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
MS4A3Q96HJ5 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
MS4A3Q96HJ5 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
MS4A3Q96HJ5 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
MS4A3Q96HJ5 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
MS4A3Q96HJ5 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
MS4A3Q96HJ5 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
MS4A3Q96HJ5 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
MS4A3Q96HJ5 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
MS4A3Q96HJ5 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
MS4A3Q96HJ5 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
MS4A3Q96HJ5 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
MS4A3Q96HJ5 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
MS4A3Q96HJ5 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
MS4A3Q96HJ5 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
MS4A3Q96HJ5 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
MS4A3Q96HJ5 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
MS4A3Q96HJ5 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
MS4A3Q96HJ5 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
MS4A3Q96HJ5 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
MS4A3Q96HJ5 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
MS4A3Q96HJ5 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
MS4A3Q96HJ5 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
MS4A3Q96HJ5 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
MS4A3Q96HJ5 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
MS4A3Q96HJ5 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
MS4A3Q96HJ5 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
MS4A3Q96HJ5 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
MS4A3Q96HJ5 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
MS4A3Q96HJ5 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
MS4A3Q96HJ5 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
MS4A3Q96HJ5 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
MS4A3Q96HJ5 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
MS4A3Q96HJ5 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
MS4A3Q96HJ5 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
MS4A3Q96HJ5 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
MS4A3Q96HJ5 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
MS4A3Q96HJ5 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
MS4A3Q96HJ5 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
MS4A3Q96HJ5 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
MS4A3Q96HJ5 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
MS4A3Q96HJ5 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
MS4A3Q96HJ5 ATP6V1G1-201ENST00000374050 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
MS4A3Q96HJ5 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
MS4A3Q96HJ5 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
MS4A3Q96HJ5 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
MS4A3Q96HJ5 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
MS4A3Q96HJ5 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
MS4A3Q96HJ5 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
MS4A3Q96HJ5 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
MS4A3Q96HJ5 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
MS4A3Q96HJ5 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
MS4A3Q96HJ5 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
MS4A3Q96HJ5 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
MS4A3Q96HJ5 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
MS4A3Q96HJ5 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
MS4A3Q96HJ5 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
MS4A3Q96HJ5 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
MS4A3Q96HJ5 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
MS4A3Q96HJ5 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
MS4A3Q96HJ5 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
MS4A3Q96HJ5 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
MS4A3Q96HJ5 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
MS4A3Q96HJ5 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
MS4A3Q96HJ5 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
MS4A3Q96HJ5 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
MS4A3Q96HJ5 FMC1-201ENST00000297534 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
MS4A3Q96HJ5 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms