Protein–RNA interactions for Protein: Q96GM5

SMARCD1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 1, humanhuman

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCD1Q96GM5 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SMARCD1Q96GM5 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SMARCD1Q96GM5 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SMARCD1Q96GM5 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SMARCD1Q96GM5 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SMARCD1Q96GM5 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SMARCD1Q96GM5 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SMARCD1Q96GM5 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SMARCD1Q96GM5 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SMARCD1Q96GM5 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SMARCD1Q96GM5 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
SMARCD1Q96GM5 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SMARCD1Q96GM5 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SMARCD1Q96GM5 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SMARCD1Q96GM5 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SMARCD1Q96GM5 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SMARCD1Q96GM5 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SMARCD1Q96GM5 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
SMARCD1Q96GM5 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SMARCD1Q96GM5 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
SMARCD1Q96GM5 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SMARCD1Q96GM5 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
SMARCD1Q96GM5 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SMARCD1Q96GM5 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SMARCD1Q96GM5 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SMARCD1Q96GM5 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SMARCD1Q96GM5 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SMARCD1Q96GM5 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SMARCD1Q96GM5 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SMARCD1Q96GM5 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SMARCD1Q96GM5 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SMARCD1Q96GM5 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SMARCD1Q96GM5 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SMARCD1Q96GM5 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SMARCD1Q96GM5 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
SMARCD1Q96GM5 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SMARCD1Q96GM5 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SMARCD1Q96GM5 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SMARCD1Q96GM5 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SMARCD1Q96GM5 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
SMARCD1Q96GM5 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SMARCD1Q96GM5 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SMARCD1Q96GM5 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SMARCD1Q96GM5 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SMARCD1Q96GM5 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SMARCD1Q96GM5 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SMARCD1Q96GM5 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SMARCD1Q96GM5 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SMARCD1Q96GM5 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SMARCD1Q96GM5 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SMARCD1Q96GM5 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SMARCD1Q96GM5 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SMARCD1Q96GM5 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SMARCD1Q96GM5 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
SMARCD1Q96GM5 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SMARCD1Q96GM5 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SMARCD1Q96GM5 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SMARCD1Q96GM5 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SMARCD1Q96GM5 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SMARCD1Q96GM5 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SMARCD1Q96GM5 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SMARCD1Q96GM5 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SMARCD1Q96GM5 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SMARCD1Q96GM5 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SMARCD1Q96GM5 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SMARCD1Q96GM5 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SMARCD1Q96GM5 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SMARCD1Q96GM5 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SMARCD1Q96GM5 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SMARCD1Q96GM5 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SMARCD1Q96GM5 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SMARCD1Q96GM5 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SMARCD1Q96GM5 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SMARCD1Q96GM5 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SMARCD1Q96GM5 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SMARCD1Q96GM5 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SMARCD1Q96GM5 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
SMARCD1Q96GM5 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SMARCD1Q96GM5 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SMARCD1Q96GM5 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SMARCD1Q96GM5 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SMARCD1Q96GM5 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
SMARCD1Q96GM5 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SMARCD1Q96GM5 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SMARCD1Q96GM5 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SMARCD1Q96GM5 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SMARCD1Q96GM5 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SMARCD1Q96GM5 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SMARCD1Q96GM5 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
SMARCD1Q96GM5 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SMARCD1Q96GM5 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SMARCD1Q96GM5 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
SMARCD1Q96GM5 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SMARCD1Q96GM5 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SMARCD1Q96GM5 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SMARCD1Q96GM5 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SMARCD1Q96GM5 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SMARCD1Q96GM5 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
SMARCD1Q96GM5 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SMARCD1Q96GM5 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms