Protein–RNA interactions for Protein: Q96F86

EDC3, Enhancer of mRNA-decapping protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDC3Q96F86 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
EDC3Q96F86 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
EDC3Q96F86 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
EDC3Q96F86 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
EDC3Q96F86 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
EDC3Q96F86 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
EDC3Q96F86 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
EDC3Q96F86 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
EDC3Q96F86 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
EDC3Q96F86 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
EDC3Q96F86 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
EDC3Q96F86 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
EDC3Q96F86 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
EDC3Q96F86 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
EDC3Q96F86 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
EDC3Q96F86 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
EDC3Q96F86 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
EDC3Q96F86 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
EDC3Q96F86 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
EDC3Q96F86 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
EDC3Q96F86 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
EDC3Q96F86 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
EDC3Q96F86 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
EDC3Q96F86 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
EDC3Q96F86 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
EDC3Q96F86 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
EDC3Q96F86 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
EDC3Q96F86 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
EDC3Q96F86 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
EDC3Q96F86 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
EDC3Q96F86 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
EDC3Q96F86 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
EDC3Q96F86 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
EDC3Q96F86 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
EDC3Q96F86 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
EDC3Q96F86 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
EDC3Q96F86 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
EDC3Q96F86 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
EDC3Q96F86 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
EDC3Q96F86 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
EDC3Q96F86 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
EDC3Q96F86 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
EDC3Q96F86 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
EDC3Q96F86 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
EDC3Q96F86 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
EDC3Q96F86 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
EDC3Q96F86 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
EDC3Q96F86 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
EDC3Q96F86 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
EDC3Q96F86 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
EDC3Q96F86 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
EDC3Q96F86 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
EDC3Q96F86 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
EDC3Q96F86 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
EDC3Q96F86 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
EDC3Q96F86 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
EDC3Q96F86 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
EDC3Q96F86 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
EDC3Q96F86 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
EDC3Q96F86 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
EDC3Q96F86 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
EDC3Q96F86 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
EDC3Q96F86 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
EDC3Q96F86 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
EDC3Q96F86 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
EDC3Q96F86 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
EDC3Q96F86 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
EDC3Q96F86 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC28.64■■■□□ 2.18
EDC3Q96F86 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
EDC3Q96F86 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
EDC3Q96F86 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
EDC3Q96F86 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
EDC3Q96F86 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
EDC3Q96F86 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
EDC3Q96F86 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
EDC3Q96F86 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
EDC3Q96F86 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
EDC3Q96F86 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
EDC3Q96F86 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
EDC3Q96F86 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
EDC3Q96F86 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
EDC3Q96F86 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
EDC3Q96F86 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
EDC3Q96F86 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
EDC3Q96F86 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
EDC3Q96F86 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
EDC3Q96F86 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
EDC3Q96F86 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
EDC3Q96F86 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
EDC3Q96F86 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
EDC3Q96F86 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
EDC3Q96F86 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
EDC3Q96F86 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
EDC3Q96F86 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC28.6■■■□□ 2.17
EDC3Q96F86 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
EDC3Q96F86 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
EDC3Q96F86 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
EDC3Q96F86 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
EDC3Q96F86 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
EDC3Q96F86 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms