Protein–RNA interactions for Protein: Q96F44

TRIM11, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM11, humanhuman

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM11Q96F44 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRIM11Q96F44 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRIM11Q96F44 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRIM11Q96F44 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRIM11Q96F44 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRIM11Q96F44 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
TRIM11Q96F44 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
TRIM11Q96F44 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
TRIM11Q96F44 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRIM11Q96F44 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRIM11Q96F44 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRIM11Q96F44 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRIM11Q96F44 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRIM11Q96F44 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRIM11Q96F44 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRIM11Q96F44 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRIM11Q96F44 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRIM11Q96F44 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRIM11Q96F44 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRIM11Q96F44 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRIM11Q96F44 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRIM11Q96F44 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRIM11Q96F44 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRIM11Q96F44 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRIM11Q96F44 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRIM11Q96F44 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRIM11Q96F44 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRIM11Q96F44 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRIM11Q96F44 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRIM11Q96F44 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRIM11Q96F44 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRIM11Q96F44 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRIM11Q96F44 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRIM11Q96F44 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRIM11Q96F44 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRIM11Q96F44 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRIM11Q96F44 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRIM11Q96F44 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRIM11Q96F44 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
TRIM11Q96F44 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRIM11Q96F44 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
TRIM11Q96F44 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TRIM11Q96F44 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
TRIM11Q96F44 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
TRIM11Q96F44 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRIM11Q96F44 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRIM11Q96F44 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRIM11Q96F44 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRIM11Q96F44 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRIM11Q96F44 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRIM11Q96F44 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRIM11Q96F44 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRIM11Q96F44 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRIM11Q96F44 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRIM11Q96F44 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRIM11Q96F44 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRIM11Q96F44 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRIM11Q96F44 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRIM11Q96F44 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
TRIM11Q96F44 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRIM11Q96F44 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRIM11Q96F44 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRIM11Q96F44 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
TRIM11Q96F44 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRIM11Q96F44 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRIM11Q96F44 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
TRIM11Q96F44 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRIM11Q96F44 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRIM11Q96F44 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRIM11Q96F44 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRIM11Q96F44 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRIM11Q96F44 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRIM11Q96F44 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
TRIM11Q96F44 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRIM11Q96F44 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRIM11Q96F44 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRIM11Q96F44 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRIM11Q96F44 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
TRIM11Q96F44 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRIM11Q96F44 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRIM11Q96F44 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRIM11Q96F44 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
TRIM11Q96F44 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRIM11Q96F44 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRIM11Q96F44 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRIM11Q96F44 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
TRIM11Q96F44 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRIM11Q96F44 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
TRIM11Q96F44 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRIM11Q96F44 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRIM11Q96F44 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRIM11Q96F44 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRIM11Q96F44 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRIM11Q96F44 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRIM11Q96F44 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRIM11Q96F44 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRIM11Q96F44 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRIM11Q96F44 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
TRIM11Q96F44 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRIM11Q96F44 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms