Protein–RNA interactions for Protein: Q96E17

RAB3C, Ras-related protein Rab-3C, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3CQ96E17 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RAB3CQ96E17 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RAB3CQ96E17 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RAB3CQ96E17 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RAB3CQ96E17 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
RAB3CQ96E17 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RAB3CQ96E17 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RAB3CQ96E17 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RAB3CQ96E17 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RAB3CQ96E17 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RAB3CQ96E17 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RAB3CQ96E17 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
RAB3CQ96E17 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RAB3CQ96E17 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RAB3CQ96E17 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RAB3CQ96E17 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RAB3CQ96E17 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RAB3CQ96E17 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RAB3CQ96E17 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RAB3CQ96E17 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RAB3CQ96E17 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RAB3CQ96E17 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RAB3CQ96E17 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RAB3CQ96E17 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RAB3CQ96E17 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RAB3CQ96E17 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RAB3CQ96E17 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RAB3CQ96E17 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RAB3CQ96E17 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RAB3CQ96E17 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RAB3CQ96E17 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RAB3CQ96E17 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RAB3CQ96E17 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RAB3CQ96E17 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RAB3CQ96E17 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RAB3CQ96E17 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RAB3CQ96E17 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RAB3CQ96E17 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RAB3CQ96E17 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RAB3CQ96E17 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RAB3CQ96E17 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RAB3CQ96E17 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RAB3CQ96E17 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RAB3CQ96E17 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RAB3CQ96E17 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RAB3CQ96E17 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RAB3CQ96E17 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RAB3CQ96E17 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
RAB3CQ96E17 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RAB3CQ96E17 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RAB3CQ96E17 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RAB3CQ96E17 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RAB3CQ96E17 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RAB3CQ96E17 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
RAB3CQ96E17 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
RAB3CQ96E17 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
RAB3CQ96E17 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
RAB3CQ96E17 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
RAB3CQ96E17 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
RAB3CQ96E17 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
RAB3CQ96E17 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RAB3CQ96E17 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RAB3CQ96E17 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RAB3CQ96E17 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RAB3CQ96E17 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RAB3CQ96E17 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RAB3CQ96E17 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RAB3CQ96E17 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RAB3CQ96E17 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RAB3CQ96E17 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RAB3CQ96E17 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RAB3CQ96E17 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RAB3CQ96E17 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
RAB3CQ96E17 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
RAB3CQ96E17 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
RAB3CQ96E17 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RAB3CQ96E17 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
RAB3CQ96E17 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RAB3CQ96E17 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
RAB3CQ96E17 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RAB3CQ96E17 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RAB3CQ96E17 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RAB3CQ96E17 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RAB3CQ96E17 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RAB3CQ96E17 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RAB3CQ96E17 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RAB3CQ96E17 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RAB3CQ96E17 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RAB3CQ96E17 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RAB3CQ96E17 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RAB3CQ96E17 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RAB3CQ96E17 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RAB3CQ96E17 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RAB3CQ96E17 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RAB3CQ96E17 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RAB3CQ96E17 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RAB3CQ96E17 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RAB3CQ96E17 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RAB3CQ96E17 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RAB3CQ96E17 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms