Protein–RNA interactions for Protein: Q96DU9

PABPC5, Polyadenylate-binding protein 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC5Q96DU9 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PABPC5Q96DU9 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PABPC5Q96DU9 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PABPC5Q96DU9 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PABPC5Q96DU9 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PABPC5Q96DU9 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PABPC5Q96DU9 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
PABPC5Q96DU9 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PABPC5Q96DU9 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PABPC5Q96DU9 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PABPC5Q96DU9 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PABPC5Q96DU9 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PABPC5Q96DU9 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PABPC5Q96DU9 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
PABPC5Q96DU9 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PABPC5Q96DU9 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PABPC5Q96DU9 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PABPC5Q96DU9 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PABPC5Q96DU9 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PABPC5Q96DU9 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PABPC5Q96DU9 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PABPC5Q96DU9 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PABPC5Q96DU9 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PABPC5Q96DU9 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PABPC5Q96DU9 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PABPC5Q96DU9 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PABPC5Q96DU9 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PABPC5Q96DU9 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PABPC5Q96DU9 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PABPC5Q96DU9 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PABPC5Q96DU9 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PABPC5Q96DU9 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PABPC5Q96DU9 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PABPC5Q96DU9 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PABPC5Q96DU9 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PABPC5Q96DU9 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PABPC5Q96DU9 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PABPC5Q96DU9 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PABPC5Q96DU9 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PABPC5Q96DU9 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PABPC5Q96DU9 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PABPC5Q96DU9 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PABPC5Q96DU9 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PABPC5Q96DU9 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PABPC5Q96DU9 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
PABPC5Q96DU9 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PABPC5Q96DU9 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PABPC5Q96DU9 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PABPC5Q96DU9 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PABPC5Q96DU9 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PABPC5Q96DU9 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PABPC5Q96DU9 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
PABPC5Q96DU9 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PABPC5Q96DU9 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PABPC5Q96DU9 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PABPC5Q96DU9 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PABPC5Q96DU9 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PABPC5Q96DU9 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PABPC5Q96DU9 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
PABPC5Q96DU9 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PABPC5Q96DU9 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PABPC5Q96DU9 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
PABPC5Q96DU9 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PABPC5Q96DU9 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
PABPC5Q96DU9 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
PABPC5Q96DU9 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PABPC5Q96DU9 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PABPC5Q96DU9 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PABPC5Q96DU9 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PABPC5Q96DU9 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
PABPC5Q96DU9 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PABPC5Q96DU9 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PABPC5Q96DU9 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PABPC5Q96DU9 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PABPC5Q96DU9 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PABPC5Q96DU9 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PABPC5Q96DU9 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PABPC5Q96DU9 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PABPC5Q96DU9 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PABPC5Q96DU9 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PABPC5Q96DU9 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PABPC5Q96DU9 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PABPC5Q96DU9 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PABPC5Q96DU9 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PABPC5Q96DU9 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PABPC5Q96DU9 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PABPC5Q96DU9 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PABPC5Q96DU9 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
PABPC5Q96DU9 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
PABPC5Q96DU9 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PABPC5Q96DU9 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PABPC5Q96DU9 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PABPC5Q96DU9 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PABPC5Q96DU9 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PABPC5Q96DU9 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PABPC5Q96DU9 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PABPC5Q96DU9 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PABPC5Q96DU9 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PABPC5Q96DU9 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PABPC5Q96DU9 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms