Protein–RNA interactions for Protein: Q96DT6

ATG4C, Cysteine protease ATG4C, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4CQ96DT6 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ATG4CQ96DT6 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ATG4CQ96DT6 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ATG4CQ96DT6 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ATG4CQ96DT6 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
ATG4CQ96DT6 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ATG4CQ96DT6 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ATG4CQ96DT6 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ATG4CQ96DT6 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ATG4CQ96DT6 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ATG4CQ96DT6 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ATG4CQ96DT6 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ATG4CQ96DT6 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ATG4CQ96DT6 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ATG4CQ96DT6 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ATG4CQ96DT6 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ATG4CQ96DT6 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ATG4CQ96DT6 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ATG4CQ96DT6 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ATG4CQ96DT6 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ATG4CQ96DT6 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ATG4CQ96DT6 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
ATG4CQ96DT6 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ATG4CQ96DT6 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ATG4CQ96DT6 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
ATG4CQ96DT6 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ATG4CQ96DT6 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ATG4CQ96DT6 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ATG4CQ96DT6 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ATG4CQ96DT6 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ATG4CQ96DT6 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ATG4CQ96DT6 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
ATG4CQ96DT6 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ATG4CQ96DT6 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
ATG4CQ96DT6 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
ATG4CQ96DT6 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ATG4CQ96DT6 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
ATG4CQ96DT6 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
ATG4CQ96DT6 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
ATG4CQ96DT6 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
ATG4CQ96DT6 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ATG4CQ96DT6 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
ATG4CQ96DT6 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
ATG4CQ96DT6 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
ATG4CQ96DT6 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ATG4CQ96DT6 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ATG4CQ96DT6 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ATG4CQ96DT6 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ATG4CQ96DT6 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
ATG4CQ96DT6 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ATG4CQ96DT6 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
ATG4CQ96DT6 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ATG4CQ96DT6 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ATG4CQ96DT6 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
ATG4CQ96DT6 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
ATG4CQ96DT6 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC27.26■■□□□ 1.95
ATG4CQ96DT6 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
ATG4CQ96DT6 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
ATG4CQ96DT6 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
ATG4CQ96DT6 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ATG4CQ96DT6 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
ATG4CQ96DT6 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ATG4CQ96DT6 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ATG4CQ96DT6 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ATG4CQ96DT6 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ATG4CQ96DT6 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ATG4CQ96DT6 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ATG4CQ96DT6 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ATG4CQ96DT6 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ATG4CQ96DT6 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ATG4CQ96DT6 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ATG4CQ96DT6 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
ATG4CQ96DT6 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ATG4CQ96DT6 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ATG4CQ96DT6 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ATG4CQ96DT6 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ATG4CQ96DT6 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ATG4CQ96DT6 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ATG4CQ96DT6 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ATG4CQ96DT6 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ATG4CQ96DT6 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ATG4CQ96DT6 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ATG4CQ96DT6 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ATG4CQ96DT6 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ATG4CQ96DT6 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
ATG4CQ96DT6 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
ATG4CQ96DT6 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
ATG4CQ96DT6 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
ATG4CQ96DT6 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ATG4CQ96DT6 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ATG4CQ96DT6 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ATG4CQ96DT6 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ATG4CQ96DT6 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ATG4CQ96DT6 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ATG4CQ96DT6 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ATG4CQ96DT6 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ATG4CQ96DT6 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ATG4CQ96DT6 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ATG4CQ96DT6 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ATG4CQ96DT6 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 132.2 ms