Protein–RNA interactions for Protein: Q96DL1

NXPE2, NXPE family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NXPE2Q96DL1 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NXPE2Q96DL1 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NXPE2Q96DL1 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NXPE2Q96DL1 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NXPE2Q96DL1 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NXPE2Q96DL1 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NXPE2Q96DL1 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NXPE2Q96DL1 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NXPE2Q96DL1 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
NXPE2Q96DL1 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NXPE2Q96DL1 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NXPE2Q96DL1 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NXPE2Q96DL1 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NXPE2Q96DL1 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NXPE2Q96DL1 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NXPE2Q96DL1 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NXPE2Q96DL1 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NXPE2Q96DL1 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NXPE2Q96DL1 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NXPE2Q96DL1 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NXPE2Q96DL1 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NXPE2Q96DL1 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NXPE2Q96DL1 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NXPE2Q96DL1 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NXPE2Q96DL1 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NXPE2Q96DL1 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NXPE2Q96DL1 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NXPE2Q96DL1 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NXPE2Q96DL1 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NXPE2Q96DL1 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NXPE2Q96DL1 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NXPE2Q96DL1 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NXPE2Q96DL1 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
NXPE2Q96DL1 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NXPE2Q96DL1 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NXPE2Q96DL1 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NXPE2Q96DL1 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NXPE2Q96DL1 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NXPE2Q96DL1 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NXPE2Q96DL1 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NXPE2Q96DL1 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NXPE2Q96DL1 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NXPE2Q96DL1 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
NXPE2Q96DL1 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NXPE2Q96DL1 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
NXPE2Q96DL1 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
NXPE2Q96DL1 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
NXPE2Q96DL1 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NXPE2Q96DL1 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NXPE2Q96DL1 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NXPE2Q96DL1 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NXPE2Q96DL1 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NXPE2Q96DL1 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NXPE2Q96DL1 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NXPE2Q96DL1 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NXPE2Q96DL1 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NXPE2Q96DL1 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NXPE2Q96DL1 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NXPE2Q96DL1 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NXPE2Q96DL1 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NXPE2Q96DL1 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NXPE2Q96DL1 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
NXPE2Q96DL1 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
NXPE2Q96DL1 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NXPE2Q96DL1 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NXPE2Q96DL1 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NXPE2Q96DL1 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NXPE2Q96DL1 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NXPE2Q96DL1 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NXPE2Q96DL1 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NXPE2Q96DL1 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NXPE2Q96DL1 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NXPE2Q96DL1 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NXPE2Q96DL1 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
NXPE2Q96DL1 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NXPE2Q96DL1 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NXPE2Q96DL1 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NXPE2Q96DL1 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NXPE2Q96DL1 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
NXPE2Q96DL1 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NXPE2Q96DL1 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NXPE2Q96DL1 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NXPE2Q96DL1 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NXPE2Q96DL1 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NXPE2Q96DL1 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NXPE2Q96DL1 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NXPE2Q96DL1 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NXPE2Q96DL1 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NXPE2Q96DL1 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
NXPE2Q96DL1 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NXPE2Q96DL1 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NXPE2Q96DL1 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NXPE2Q96DL1 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NXPE2Q96DL1 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NXPE2Q96DL1 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NXPE2Q96DL1 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NXPE2Q96DL1 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NXPE2Q96DL1 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NXPE2Q96DL1 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NXPE2Q96DL1 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.4 ms