Protein–RNA interactions for Protein: Q96DB5

RMDN1, Regulator of microtubule dynamics protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RMDN1Q96DB5 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RMDN1Q96DB5 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RMDN1Q96DB5 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RMDN1Q96DB5 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RMDN1Q96DB5 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RMDN1Q96DB5 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
RMDN1Q96DB5 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RMDN1Q96DB5 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RMDN1Q96DB5 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RMDN1Q96DB5 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RMDN1Q96DB5 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RMDN1Q96DB5 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RMDN1Q96DB5 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RMDN1Q96DB5 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RMDN1Q96DB5 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RMDN1Q96DB5 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RMDN1Q96DB5 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RMDN1Q96DB5 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RMDN1Q96DB5 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
RMDN1Q96DB5 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RMDN1Q96DB5 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RMDN1Q96DB5 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RMDN1Q96DB5 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RMDN1Q96DB5 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RMDN1Q96DB5 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RMDN1Q96DB5 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RMDN1Q96DB5 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RMDN1Q96DB5 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RMDN1Q96DB5 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RMDN1Q96DB5 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RMDN1Q96DB5 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RMDN1Q96DB5 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RMDN1Q96DB5 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RMDN1Q96DB5 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
RMDN1Q96DB5 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
RMDN1Q96DB5 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RMDN1Q96DB5 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RMDN1Q96DB5 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RMDN1Q96DB5 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
RMDN1Q96DB5 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RMDN1Q96DB5 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RMDN1Q96DB5 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
RMDN1Q96DB5 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RMDN1Q96DB5 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RMDN1Q96DB5 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RMDN1Q96DB5 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RMDN1Q96DB5 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RMDN1Q96DB5 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RMDN1Q96DB5 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RMDN1Q96DB5 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RMDN1Q96DB5 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RMDN1Q96DB5 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RMDN1Q96DB5 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RMDN1Q96DB5 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RMDN1Q96DB5 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
RMDN1Q96DB5 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RMDN1Q96DB5 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RMDN1Q96DB5 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RMDN1Q96DB5 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RMDN1Q96DB5 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RMDN1Q96DB5 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RMDN1Q96DB5 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RMDN1Q96DB5 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RMDN1Q96DB5 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
RMDN1Q96DB5 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
RMDN1Q96DB5 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RMDN1Q96DB5 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RMDN1Q96DB5 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RMDN1Q96DB5 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RMDN1Q96DB5 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RMDN1Q96DB5 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RMDN1Q96DB5 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RMDN1Q96DB5 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RMDN1Q96DB5 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RMDN1Q96DB5 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RMDN1Q96DB5 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RMDN1Q96DB5 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RMDN1Q96DB5 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RMDN1Q96DB5 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RMDN1Q96DB5 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RMDN1Q96DB5 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RMDN1Q96DB5 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RMDN1Q96DB5 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RMDN1Q96DB5 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RMDN1Q96DB5 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RMDN1Q96DB5 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RMDN1Q96DB5 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RMDN1Q96DB5 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RMDN1Q96DB5 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RMDN1Q96DB5 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RMDN1Q96DB5 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RMDN1Q96DB5 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RMDN1Q96DB5 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RMDN1Q96DB5 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RMDN1Q96DB5 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RMDN1Q96DB5 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
RMDN1Q96DB5 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RMDN1Q96DB5 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RMDN1Q96DB5 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RMDN1Q96DB5 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms