Protein–RNA interactions for Protein: Q96CP7

TLCD1, Calfacilitin, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLCD1Q96CP7 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TLCD1Q96CP7 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TLCD1Q96CP7 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TLCD1Q96CP7 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TLCD1Q96CP7 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TLCD1Q96CP7 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TLCD1Q96CP7 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TLCD1Q96CP7 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TLCD1Q96CP7 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TLCD1Q96CP7 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TLCD1Q96CP7 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TLCD1Q96CP7 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TLCD1Q96CP7 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
TLCD1Q96CP7 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TLCD1Q96CP7 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TLCD1Q96CP7 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TLCD1Q96CP7 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TLCD1Q96CP7 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
TLCD1Q96CP7 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TLCD1Q96CP7 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TLCD1Q96CP7 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TLCD1Q96CP7 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TLCD1Q96CP7 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TLCD1Q96CP7 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TLCD1Q96CP7 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TLCD1Q96CP7 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
TLCD1Q96CP7 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TLCD1Q96CP7 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TLCD1Q96CP7 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TLCD1Q96CP7 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TLCD1Q96CP7 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TLCD1Q96CP7 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TLCD1Q96CP7 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TLCD1Q96CP7 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
TLCD1Q96CP7 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TLCD1Q96CP7 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TLCD1Q96CP7 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TLCD1Q96CP7 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TLCD1Q96CP7 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TLCD1Q96CP7 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
TLCD1Q96CP7 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TLCD1Q96CP7 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TLCD1Q96CP7 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TLCD1Q96CP7 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TLCD1Q96CP7 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TLCD1Q96CP7 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TLCD1Q96CP7 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
TLCD1Q96CP7 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TLCD1Q96CP7 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TLCD1Q96CP7 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TLCD1Q96CP7 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TLCD1Q96CP7 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TLCD1Q96CP7 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TLCD1Q96CP7 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
TLCD1Q96CP7 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TLCD1Q96CP7 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TLCD1Q96CP7 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TLCD1Q96CP7 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TLCD1Q96CP7 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TLCD1Q96CP7 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TLCD1Q96CP7 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TLCD1Q96CP7 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TLCD1Q96CP7 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TLCD1Q96CP7 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TLCD1Q96CP7 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TLCD1Q96CP7 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TLCD1Q96CP7 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TLCD1Q96CP7 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TLCD1Q96CP7 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TLCD1Q96CP7 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TLCD1Q96CP7 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TLCD1Q96CP7 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TLCD1Q96CP7 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TLCD1Q96CP7 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TLCD1Q96CP7 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TLCD1Q96CP7 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TLCD1Q96CP7 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TLCD1Q96CP7 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TLCD1Q96CP7 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TLCD1Q96CP7 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
TLCD1Q96CP7 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TLCD1Q96CP7 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TLCD1Q96CP7 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TLCD1Q96CP7 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TLCD1Q96CP7 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TLCD1Q96CP7 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TLCD1Q96CP7 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TLCD1Q96CP7 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TLCD1Q96CP7 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TLCD1Q96CP7 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TLCD1Q96CP7 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TLCD1Q96CP7 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TLCD1Q96CP7 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TLCD1Q96CP7 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TLCD1Q96CP7 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TLCD1Q96CP7 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TLCD1Q96CP7 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TLCD1Q96CP7 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TLCD1Q96CP7 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TLCD1Q96CP7 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms