Protein–RNA interactions for Protein: Q96C92

SDCCAG3, Serologically defined colon cancer antigen 3, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDCCAG3Q96C92 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SDCCAG3Q96C92 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SDCCAG3Q96C92 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SDCCAG3Q96C92 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SDCCAG3Q96C92 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SDCCAG3Q96C92 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SDCCAG3Q96C92 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SDCCAG3Q96C92 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SDCCAG3Q96C92 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SDCCAG3Q96C92 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SDCCAG3Q96C92 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SDCCAG3Q96C92 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SDCCAG3Q96C92 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SDCCAG3Q96C92 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SDCCAG3Q96C92 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SDCCAG3Q96C92 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SDCCAG3Q96C92 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SDCCAG3Q96C92 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SDCCAG3Q96C92 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SDCCAG3Q96C92 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SDCCAG3Q96C92 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SDCCAG3Q96C92 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SDCCAG3Q96C92 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SDCCAG3Q96C92 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SDCCAG3Q96C92 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SDCCAG3Q96C92 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SDCCAG3Q96C92 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SDCCAG3Q96C92 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SDCCAG3Q96C92 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SDCCAG3Q96C92 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SDCCAG3Q96C92 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SDCCAG3Q96C92 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SDCCAG3Q96C92 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SDCCAG3Q96C92 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SDCCAG3Q96C92 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SDCCAG3Q96C92 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SDCCAG3Q96C92 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SDCCAG3Q96C92 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SDCCAG3Q96C92 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SDCCAG3Q96C92 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SDCCAG3Q96C92 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SDCCAG3Q96C92 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SDCCAG3Q96C92 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SDCCAG3Q96C92 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SDCCAG3Q96C92 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SDCCAG3Q96C92 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SDCCAG3Q96C92 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SDCCAG3Q96C92 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SDCCAG3Q96C92 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SDCCAG3Q96C92 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SDCCAG3Q96C92 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SDCCAG3Q96C92 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SDCCAG3Q96C92 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SDCCAG3Q96C92 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SDCCAG3Q96C92 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SDCCAG3Q96C92 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SDCCAG3Q96C92 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SDCCAG3Q96C92 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SDCCAG3Q96C92 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SDCCAG3Q96C92 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SDCCAG3Q96C92 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SDCCAG3Q96C92 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SDCCAG3Q96C92 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SDCCAG3Q96C92 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SDCCAG3Q96C92 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SDCCAG3Q96C92 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SDCCAG3Q96C92 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SDCCAG3Q96C92 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SDCCAG3Q96C92 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SDCCAG3Q96C92 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SDCCAG3Q96C92 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SDCCAG3Q96C92 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SDCCAG3Q96C92 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SDCCAG3Q96C92 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SDCCAG3Q96C92 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SDCCAG3Q96C92 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SDCCAG3Q96C92 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SDCCAG3Q96C92 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SDCCAG3Q96C92 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SDCCAG3Q96C92 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SDCCAG3Q96C92 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SDCCAG3Q96C92 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SDCCAG3Q96C92 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SDCCAG3Q96C92 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SDCCAG3Q96C92 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SDCCAG3Q96C92 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SDCCAG3Q96C92 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SDCCAG3Q96C92 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SDCCAG3Q96C92 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SDCCAG3Q96C92 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SDCCAG3Q96C92 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SDCCAG3Q96C92 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SDCCAG3Q96C92 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SDCCAG3Q96C92 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SDCCAG3Q96C92 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SDCCAG3Q96C92 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SDCCAG3Q96C92 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SDCCAG3Q96C92 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SDCCAG3Q96C92 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SDCCAG3Q96C92 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms