Protein–RNA interactions for Protein: Q96C74

ROPN1L, Ropporin-1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROPN1LQ96C74 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ROPN1LQ96C74 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ROPN1LQ96C74 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ROPN1LQ96C74 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ROPN1LQ96C74 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ROPN1LQ96C74 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ROPN1LQ96C74 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ROPN1LQ96C74 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ROPN1LQ96C74 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ROPN1LQ96C74 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ROPN1LQ96C74 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ROPN1LQ96C74 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ROPN1LQ96C74 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ROPN1LQ96C74 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ROPN1LQ96C74 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ROPN1LQ96C74 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ROPN1LQ96C74 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ROPN1LQ96C74 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ROPN1LQ96C74 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ROPN1LQ96C74 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ROPN1LQ96C74 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ROPN1LQ96C74 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ROPN1LQ96C74 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ROPN1LQ96C74 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ROPN1LQ96C74 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ROPN1LQ96C74 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ROPN1LQ96C74 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ROPN1LQ96C74 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ROPN1LQ96C74 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ROPN1LQ96C74 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ROPN1LQ96C74 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
ROPN1LQ96C74 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ROPN1LQ96C74 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ROPN1LQ96C74 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ROPN1LQ96C74 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ROPN1LQ96C74 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ROPN1LQ96C74 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ROPN1LQ96C74 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ROPN1LQ96C74 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
ROPN1LQ96C74 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ROPN1LQ96C74 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ROPN1LQ96C74 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ROPN1LQ96C74 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ROPN1LQ96C74 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ROPN1LQ96C74 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ROPN1LQ96C74 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ROPN1LQ96C74 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ROPN1LQ96C74 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ROPN1LQ96C74 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ROPN1LQ96C74 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ROPN1LQ96C74 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ROPN1LQ96C74 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ROPN1LQ96C74 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ROPN1LQ96C74 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ROPN1LQ96C74 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ROPN1LQ96C74 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ROPN1LQ96C74 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ROPN1LQ96C74 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ROPN1LQ96C74 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ROPN1LQ96C74 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ROPN1LQ96C74 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ROPN1LQ96C74 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ROPN1LQ96C74 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ROPN1LQ96C74 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ROPN1LQ96C74 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ROPN1LQ96C74 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ROPN1LQ96C74 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ROPN1LQ96C74 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ROPN1LQ96C74 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ROPN1LQ96C74 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ROPN1LQ96C74 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ROPN1LQ96C74 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ROPN1LQ96C74 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ROPN1LQ96C74 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ROPN1LQ96C74 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ROPN1LQ96C74 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ROPN1LQ96C74 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ROPN1LQ96C74 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ROPN1LQ96C74 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ROPN1LQ96C74 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ROPN1LQ96C74 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ROPN1LQ96C74 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ROPN1LQ96C74 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ROPN1LQ96C74 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ROPN1LQ96C74 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ROPN1LQ96C74 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ROPN1LQ96C74 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ROPN1LQ96C74 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ROPN1LQ96C74 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ROPN1LQ96C74 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ROPN1LQ96C74 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
ROPN1LQ96C74 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ROPN1LQ96C74 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ROPN1LQ96C74 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ROPN1LQ96C74 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ROPN1LQ96C74 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ROPN1LQ96C74 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ROPN1LQ96C74 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
ROPN1LQ96C74 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ROPN1LQ96C74 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms