Protein–RNA interactions for Protein: Q96AW1

VOPP1, Vesicular, overexpressed in cancer, prosurvival protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VOPP1Q96AW1 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
VOPP1Q96AW1 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
VOPP1Q96AW1 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
VOPP1Q96AW1 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
VOPP1Q96AW1 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
VOPP1Q96AW1 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
VOPP1Q96AW1 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
VOPP1Q96AW1 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
VOPP1Q96AW1 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
VOPP1Q96AW1 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
VOPP1Q96AW1 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
VOPP1Q96AW1 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
VOPP1Q96AW1 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
VOPP1Q96AW1 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
VOPP1Q96AW1 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
VOPP1Q96AW1 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
VOPP1Q96AW1 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
VOPP1Q96AW1 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
VOPP1Q96AW1 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
VOPP1Q96AW1 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
VOPP1Q96AW1 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
VOPP1Q96AW1 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
VOPP1Q96AW1 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
VOPP1Q96AW1 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
VOPP1Q96AW1 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
VOPP1Q96AW1 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
VOPP1Q96AW1 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
VOPP1Q96AW1 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
VOPP1Q96AW1 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
VOPP1Q96AW1 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
VOPP1Q96AW1 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
VOPP1Q96AW1 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
VOPP1Q96AW1 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
VOPP1Q96AW1 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
VOPP1Q96AW1 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
VOPP1Q96AW1 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
VOPP1Q96AW1 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
VOPP1Q96AW1 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
VOPP1Q96AW1 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
VOPP1Q96AW1 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
VOPP1Q96AW1 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
VOPP1Q96AW1 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
VOPP1Q96AW1 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
VOPP1Q96AW1 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
VOPP1Q96AW1 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
VOPP1Q96AW1 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
VOPP1Q96AW1 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
VOPP1Q96AW1 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
VOPP1Q96AW1 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
VOPP1Q96AW1 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
VOPP1Q96AW1 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
VOPP1Q96AW1 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
VOPP1Q96AW1 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
VOPP1Q96AW1 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
VOPP1Q96AW1 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
VOPP1Q96AW1 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
VOPP1Q96AW1 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
VOPP1Q96AW1 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
VOPP1Q96AW1 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
VOPP1Q96AW1 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
VOPP1Q96AW1 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
VOPP1Q96AW1 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
VOPP1Q96AW1 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
VOPP1Q96AW1 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
VOPP1Q96AW1 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
VOPP1Q96AW1 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
VOPP1Q96AW1 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
VOPP1Q96AW1 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
VOPP1Q96AW1 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
VOPP1Q96AW1 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
VOPP1Q96AW1 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
VOPP1Q96AW1 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
VOPP1Q96AW1 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
VOPP1Q96AW1 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
VOPP1Q96AW1 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
VOPP1Q96AW1 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
VOPP1Q96AW1 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
VOPP1Q96AW1 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
VOPP1Q96AW1 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
VOPP1Q96AW1 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
VOPP1Q96AW1 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
VOPP1Q96AW1 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
VOPP1Q96AW1 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
VOPP1Q96AW1 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
VOPP1Q96AW1 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
VOPP1Q96AW1 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
VOPP1Q96AW1 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
VOPP1Q96AW1 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
VOPP1Q96AW1 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
VOPP1Q96AW1 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
VOPP1Q96AW1 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
VOPP1Q96AW1 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
VOPP1Q96AW1 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
VOPP1Q96AW1 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
VOPP1Q96AW1 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
VOPP1Q96AW1 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
VOPP1Q96AW1 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
VOPP1Q96AW1 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
VOPP1Q96AW1 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
VOPP1Q96AW1 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms