Protein–RNA interactions for Protein: Q96AN5

TMEM143, Transmembrane protein 143, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM143Q96AN5 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TMEM143Q96AN5 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TMEM143Q96AN5 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TMEM143Q96AN5 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TMEM143Q96AN5 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
TMEM143Q96AN5 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TMEM143Q96AN5 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TMEM143Q96AN5 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TMEM143Q96AN5 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TMEM143Q96AN5 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TMEM143Q96AN5 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TMEM143Q96AN5 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TMEM143Q96AN5 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TMEM143Q96AN5 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TMEM143Q96AN5 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TMEM143Q96AN5 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TMEM143Q96AN5 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TMEM143Q96AN5 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TMEM143Q96AN5 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TMEM143Q96AN5 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TMEM143Q96AN5 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TMEM143Q96AN5 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TMEM143Q96AN5 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TMEM143Q96AN5 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TMEM143Q96AN5 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TMEM143Q96AN5 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TMEM143Q96AN5 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
TMEM143Q96AN5 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
TMEM143Q96AN5 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TMEM143Q96AN5 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TMEM143Q96AN5 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TMEM143Q96AN5 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TMEM143Q96AN5 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TMEM143Q96AN5 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TMEM143Q96AN5 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TMEM143Q96AN5 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TMEM143Q96AN5 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TMEM143Q96AN5 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TMEM143Q96AN5 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TMEM143Q96AN5 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TMEM143Q96AN5 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TMEM143Q96AN5 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TMEM143Q96AN5 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TMEM143Q96AN5 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TMEM143Q96AN5 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TMEM143Q96AN5 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
TMEM143Q96AN5 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
TMEM143Q96AN5 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TMEM143Q96AN5 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TMEM143Q96AN5 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TMEM143Q96AN5 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TMEM143Q96AN5 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TMEM143Q96AN5 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TMEM143Q96AN5 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TMEM143Q96AN5 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TMEM143Q96AN5 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TMEM143Q96AN5 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TMEM143Q96AN5 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TMEM143Q96AN5 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TMEM143Q96AN5 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TMEM143Q96AN5 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TMEM143Q96AN5 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TMEM143Q96AN5 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TMEM143Q96AN5 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TMEM143Q96AN5 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TMEM143Q96AN5 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TMEM143Q96AN5 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TMEM143Q96AN5 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TMEM143Q96AN5 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TMEM143Q96AN5 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TMEM143Q96AN5 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TMEM143Q96AN5 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TMEM143Q96AN5 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TMEM143Q96AN5 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TMEM143Q96AN5 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TMEM143Q96AN5 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TMEM143Q96AN5 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TMEM143Q96AN5 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
TMEM143Q96AN5 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TMEM143Q96AN5 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TMEM143Q96AN5 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TMEM143Q96AN5 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TMEM143Q96AN5 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TMEM143Q96AN5 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TMEM143Q96AN5 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TMEM143Q96AN5 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TMEM143Q96AN5 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TMEM143Q96AN5 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TMEM143Q96AN5 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TMEM143Q96AN5 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TMEM143Q96AN5 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
TMEM143Q96AN5 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
TMEM143Q96AN5 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
TMEM143Q96AN5 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TMEM143Q96AN5 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TMEM143Q96AN5 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TMEM143Q96AN5 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TMEM143Q96AN5 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
TMEM143Q96AN5 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TMEM143Q96AN5 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms