Protein–RNA interactions for Protein: Q96A05

ATP6V1E2, V-type proton ATPase subunit E 2, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6V1E2Q96A05 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP6V1E2Q96A05 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP6V1E2Q96A05 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP6V1E2Q96A05 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP6V1E2Q96A05 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP6V1E2Q96A05 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP6V1E2Q96A05 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP6V1E2Q96A05 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP6V1E2Q96A05 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP6V1E2Q96A05 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
ATP6V1E2Q96A05 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATP6V1E2Q96A05 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATP6V1E2Q96A05 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATP6V1E2Q96A05 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATP6V1E2Q96A05 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATP6V1E2Q96A05 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATP6V1E2Q96A05 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATP6V1E2Q96A05 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATP6V1E2Q96A05 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATP6V1E2Q96A05 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATP6V1E2Q96A05 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATP6V1E2Q96A05 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATP6V1E2Q96A05 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATP6V1E2Q96A05 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATP6V1E2Q96A05 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATP6V1E2Q96A05 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
ATP6V1E2Q96A05 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATP6V1E2Q96A05 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATP6V1E2Q96A05 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATP6V1E2Q96A05 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATP6V1E2Q96A05 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP6V1E2Q96A05 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP6V1E2Q96A05 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP6V1E2Q96A05 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP6V1E2Q96A05 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP6V1E2Q96A05 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP6V1E2Q96A05 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATP6V1E2Q96A05 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATP6V1E2Q96A05 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATP6V1E2Q96A05 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATP6V1E2Q96A05 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATP6V1E2Q96A05 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATP6V1E2Q96A05 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATP6V1E2Q96A05 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATP6V1E2Q96A05 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATP6V1E2Q96A05 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATP6V1E2Q96A05 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
ATP6V1E2Q96A05 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ATP6V1E2Q96A05 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
ATP6V1E2Q96A05 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ATP6V1E2Q96A05 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATP6V1E2Q96A05 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATP6V1E2Q96A05 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATP6V1E2Q96A05 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATP6V1E2Q96A05 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATP6V1E2Q96A05 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATP6V1E2Q96A05 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATP6V1E2Q96A05 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATP6V1E2Q96A05 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATP6V1E2Q96A05 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATP6V1E2Q96A05 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATP6V1E2Q96A05 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATP6V1E2Q96A05 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATP6V1E2Q96A05 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATP6V1E2Q96A05 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATP6V1E2Q96A05 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATP6V1E2Q96A05 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATP6V1E2Q96A05 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATP6V1E2Q96A05 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATP6V1E2Q96A05 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATP6V1E2Q96A05 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATP6V1E2Q96A05 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATP6V1E2Q96A05 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATP6V1E2Q96A05 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATP6V1E2Q96A05 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATP6V1E2Q96A05 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATP6V1E2Q96A05 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATP6V1E2Q96A05 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATP6V1E2Q96A05 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATP6V1E2Q96A05 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATP6V1E2Q96A05 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATP6V1E2Q96A05 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATP6V1E2Q96A05 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATP6V1E2Q96A05 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATP6V1E2Q96A05 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATP6V1E2Q96A05 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATP6V1E2Q96A05 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATP6V1E2Q96A05 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATP6V1E2Q96A05 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATP6V1E2Q96A05 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
ATP6V1E2Q96A05 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATP6V1E2Q96A05 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATP6V1E2Q96A05 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATP6V1E2Q96A05 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATP6V1E2Q96A05 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATP6V1E2Q96A05 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATP6V1E2Q96A05 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATP6V1E2Q96A05 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATP6V1E2Q96A05 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATP6V1E2Q96A05 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms